More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3242 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  56.75 
 
 
288 aa  289  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  59.29 
 
 
281 aa  279  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  55.91 
 
 
293 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  58.12 
 
 
284 aa  265  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.64 
 
 
289 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.52 
 
 
300 aa  262  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  50.7 
 
 
300 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.84 
 
 
290 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.45 
 
 
293 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.25 
 
 
293 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.74 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.38 
 
 
290 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.43 
 
 
291 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.69 
 
 
280 aa  245  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.75 
 
 
278 aa  245  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.16 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.52 
 
 
291 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.52 
 
 
291 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.64 
 
 
296 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.22 
 
 
296 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.9 
 
 
297 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  54.12 
 
 
294 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  46.72 
 
 
281 aa  226  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.31 
 
 
293 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.03 
 
 
293 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.75 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.65 
 
 
315 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  48.1 
 
 
304 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  46.95 
 
 
300 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  49.64 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  55.36 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  48.59 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.29 
 
 
279 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  47.67 
 
 
276 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.2 
 
 
295 aa  208  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.29 
 
 
297 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.71 
 
 
282 aa  198  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.58 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.64 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.86 
 
 
281 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  45.35 
 
 
316 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
486 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  40.22 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  43.27 
 
 
331 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  40.27 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.84 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2904  glutamate--tRNA ligase  39.6 
 
 
338 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.437681  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  42.96 
 
 
319 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  40.88 
 
 
297 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
498 aa  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  37.65 
 
 
373 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  38.31 
 
 
327 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.73 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
317 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.06 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  41.33 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  41.89 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
492 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
329 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  41.38 
 
 
323 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  43.16 
 
 
337 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.07 
 
 
310 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
466 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  37.29 
 
 
278 aa  158  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
477 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  40.21 
 
 
323 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.6 
 
 
311 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.44 
 
 
293 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  40.21 
 
 
327 aa  155  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
478 aa  155  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
881 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
535 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 
469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  38.18 
 
 
309 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
467 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  41.44 
 
 
302 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
467 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.06 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
476 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
477 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
508 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.99 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.06 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
482 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  37.22 
 
 
313 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  39.18 
 
 
323 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  37.81 
 
 
310 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
467 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  37.63 
 
 
338 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
469 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
481 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
492 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 
466 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
477 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  37.82 
 
 
309 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1982  glutamate--tRNA ligase  37.38 
 
 
323 aa  148  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.926165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>