More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1270 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1270  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  100 
 
 
291 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1647  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  87.29 
 
 
291 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1594  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  86.94 
 
 
291 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3026  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  65.64 
 
 
295 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3555  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  63.54 
 
 
293 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346556  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3848  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  62.5 
 
 
293 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2526  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.49 
 
 
297 aa  353  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.76 
 
 
289 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5237  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  59.79 
 
 
293 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0925  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.48 
 
 
293 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0814  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  60.48 
 
 
293 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0748  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  57.39 
 
 
290 aa  342  5e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3486  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  58.42 
 
 
290 aa  340  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4885  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  59.72 
 
 
291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4004  glutamyl-tRNA Synthetase  59.51 
 
 
300 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3840  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  55.52 
 
 
315 aa  315  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1631  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.92 
 
 
300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3286  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  54.83 
 
 
296 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0433  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.85 
 
 
300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1152  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.08 
 
 
296 aa  298  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2391  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  55.52 
 
 
280 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0957  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.45 
 
 
304 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800313  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1847  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  54.98 
 
 
294 aa  288  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4877  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  54.98 
 
 
279 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.0736778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.63 
 
 
293 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1025  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.54 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  47.77 
 
 
288 aa  264  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  52.9 
 
 
284 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3205  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  47.92 
 
 
279 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572919  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.18 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.930617  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3242  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.46 
 
 
302 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.533395  normal  0.726961 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.75 
 
 
294 aa  229  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.18 
 
 
281 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.89 
 
 
277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1491  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.91 
 
 
281 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal  0.107951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.52 
 
 
282 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  44.15 
 
 
276 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.1 
 
 
287 aa  208  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.86 
 
 
281 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0551  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.38 
 
 
281 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3084  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.33 
 
 
287 aa  201  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
464 aa  169  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  36.08 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  39.59 
 
 
323 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
492 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  41.64 
 
 
337 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  39.93 
 
 
323 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
477 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  39.78 
 
 
316 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
477 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
486 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  38.23 
 
 
323 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
472 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  35.09 
 
 
313 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
318 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 
492 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
498 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
449 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
479 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.01 
 
 
311 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
447 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
480 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
467 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
476 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  34.68 
 
 
331 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
468 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  40.52 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  34.26 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
467 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
493 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
469 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  36.18 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  38.24 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
535 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
492 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
329 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
477 aa  145  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  35.9 
 
 
314 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  32.63 
 
 
445 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  34.81 
 
 
546 aa  144  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  39.31 
 
 
300 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 
447 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
488 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
467 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.89 
 
 
291 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
441 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  34.25 
 
 
327 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
492 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
504 aa  144  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
504 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
476 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
506 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  35.89 
 
 
309 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
449 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
449 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
473 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
476 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 
478 aa  142  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>