More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0986 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  100 
 
 
445 aa  897    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 
449 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 
449 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
449 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
449 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
456 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 
447 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
456 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 
457 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
457 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
459 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 
443 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
441 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  52.7 
 
 
458 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
449 aa  428  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 
453 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
443 aa  424  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
442 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
443 aa  419  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
440 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
440 aa  412  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
441 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
443 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
441 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
447 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
441 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
444 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
444 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
472 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
485 aa  279  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
477 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
465 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
478 aa  272  9e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
485 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
469 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
881 aa  269  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
469 aa  268  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
469 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
465 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
465 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 
468 aa  266  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
482 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
490 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
508 aa  264  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
482 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
469 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2681  glutamyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
462 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
488 aa  262  8.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
485 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
469 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
469 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
469 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
469 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
504 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
504 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
512 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
464 aa  258  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  35.92 
 
 
518 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
469 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
504 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2734  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
469 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1094  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
464 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.634439  normal  0.0937945 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 
481 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
491 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
481 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
469 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
488 aa  256  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
482 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
468 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
483 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 
484 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 
484 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
485 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
469 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
469 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
484 aa  252  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
469 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
473 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
500 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  33.97 
 
 
546 aa  249  6e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 
485 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>