More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4602 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  87.25 
 
 		 447 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 447 aa  876    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  73.54 
 
 		 449 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  73.99 
 
 		 449 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  73.99 
 
 		 449 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  73.87 
 
 		 446 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 450 aa  525  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  65.77 
 
 		 458 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 		 457 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 		 459 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 457 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 		 449 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 453 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  54.95 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  56.38 
 
 		 443 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 441 aa  438  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 488 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 508 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 465 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 472 aa  260  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 466 aa  259  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 477 aa  259  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 479 aa  256  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 484 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 484 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 486 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 488 aa  252  9.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 477 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 482 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 468 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 881 aa  249  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 469 aa  249  9e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 469 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 491 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 486 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 494 aa  246  8e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 485 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 485 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 485 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 485 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 485 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 481 aa  243  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 485 aa  243  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 488 aa  242  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 490 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 478 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 464 aa  239  5e-62  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 504 aa  239  5e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 490 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 483 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 469 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 469 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 491 aa  239  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 512 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 477 aa  239  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 491 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 463 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>