More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0688 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 444 aa  874    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  49.32 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 446 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.69 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 443 aa  353  4e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 440 aa  349  4e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 483 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 481 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 481 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 481 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 477 aa  239  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 473 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 488 aa  236  5.0000000000000005e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 476 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 496 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 474 aa  233  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 491 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 464 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 481 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 881 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 488 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 468 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 483 aa  230  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 465 aa  230  5e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 477 aa  229  6e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 488 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2681  glutamyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 474 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 477 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 465 aa  226  9e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 474 aa  226  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 472 aa  222  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 477 aa  223  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 474 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 486 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 479 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 490 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 475 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>