More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0131 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  75.72 
 
 
450 aa  677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
453 aa  905    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 
449 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
449 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 
449 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  62.44 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
457 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 
456 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 
457 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
459 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 
446 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 
447 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  51 
 
 
445 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  60 
 
 
447 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
441 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 
444 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
441 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
443 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
441 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
443 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
444 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
441 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
440 aa  377  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
440 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  42 
 
 
443 aa  371  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
443 aa  370  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
439 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
442 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
433 aa  325  1e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
486 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
477 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
465 aa  233  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
465 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
488 aa  230  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 
478 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
481 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
881 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
483 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
483 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
490 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 
485 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
488 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
508 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
481 aa  220  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
482 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
494 aa  219  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 
469 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
492 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 
484 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 
484 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
484 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
479 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
477 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
488 aa  211  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
477 aa  210  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
476 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  31.15 
 
 
518 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 
464 aa  208  1e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
492 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
473 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
482 aa  206  7e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
483 aa  206  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 
490 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
484 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
476 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
486 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
485 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0704  glutamyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 
482 aa  201  3e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.574846  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
504 aa  200  3.9999999999999996e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
495 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
498 aa  199  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 
470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  30.38 
 
 
546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
469 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 
470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 
485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
464 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
493 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
467 aa  196  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>