More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1811 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
477 aa  957    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 
477 aa  527  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
465 aa  498  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
465 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  64.25 
 
 
468 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
466 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 
475 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
482 aa  455  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
508 aa  455  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
485 aa  349  7e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
478 aa  347  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
488 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
488 aa  343  5.999999999999999e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
490 aa  336  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
482 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
485 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
485 aa  326  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
481 aa  322  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
484 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
484 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
486 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.45 
 
 
546 aa  317  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
495 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
491 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
491 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
485 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
494 aa  307  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
490 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
464 aa  296  6e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
473 aa  293  6e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
488 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
504 aa  290  6e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  36.56 
 
 
518 aa  289  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
493 aa  289  8e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
469 aa  288  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
469 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
477 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.23 
 
 
495 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
499 aa  288  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 
486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
479 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
498 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
492 aa  283  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
498 aa  281  2e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
469 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
472 aa  280  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
463 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
467 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
470 aa  279  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  37.72 
 
 
445 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
535 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
449 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
484 aa  279  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
491 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
464 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
466 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 
467 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
441 aa  276  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
504 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  37.1 
 
 
588 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
492 aa  274  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
469 aa  274  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
504 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
504 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
494 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 
469 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
500 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
493 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
466 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
464 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
469 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
469 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
483 aa  271  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
469 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
472 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
472 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
509 aa  270  5e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
465 aa  270  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
473 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
471 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>