More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5563 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  78.15 
 
 		 449 aa  673    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  78.6 
 
 		 449 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 446 aa  870    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  78.15 
 
 		 449 aa  679    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  73.87 
 
 		 447 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  74.55 
 
 		 447 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 459 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 450 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 457 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  60.54 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 453 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  54.59 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 456 aa  472  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 442 aa  408  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 472 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 		 465 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 477 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 508 aa  253  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 482 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 488 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 464 aa  249  7e-65  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 469 aa  249  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 485 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 479 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 482 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 481 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 464 aa  236  4e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 486 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 472 aa  233  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 481 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 482 aa  230  3e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 492 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 491 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 474 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 474 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 490 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 467 aa  227  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 494 aa  227  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 490 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 475 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 468 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 881 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 474 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>