More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2675 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
444 aa  875    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 
443 aa  525  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
449 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
449 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 
449 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
453 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 
457 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 
459 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  48.65 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
446 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
447 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  53.02 
 
 
458 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
441 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 
457 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
441 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
456 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 
449 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
441 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
441 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
440 aa  374  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 
443 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
449 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
443 aa  360  2e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
447 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
440 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
444 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
439 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
442 aa  335  7.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
508 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
482 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
472 aa  276  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
477 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
478 aa  263  6e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
465 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 
465 aa  259  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
494 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
469 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
481 aa  252  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 
478 aa  251  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
465 aa  250  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
481 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
481 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
475 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
485 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
469 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
468 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
471 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
469 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
488 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
464 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
485 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
471 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
471 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
471 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
471 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
472 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
471 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 
485 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
486 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
464 aa  237  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
467 aa  237  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
486 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  35.81 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
480 aa  236  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
469 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
509 aa  236  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
471 aa  236  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
469 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0950  glutamyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
468 aa  236  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0894  glutamyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.101678  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
468 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
472 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
477 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>