More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2748 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  79.27 
 
 		 449 aa  704    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  77.93 
 
 		 441 aa  704    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 440 aa  884    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  73.27 
 
 		 441 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  72.87 
 
 		 441 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  72.18 
 
 		 441 aa  623  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  72.41 
 
 		 441 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 449 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  49.89 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 457 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 459 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  51.96 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 439 aa  359  4e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 447 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 444 aa  348  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 465 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 472 aa  244  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0737  glutamyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 409 aa  243  7e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.578074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 469 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 466 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 477 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 478 aa  236  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 469 aa  236  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 482 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 508 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 470 aa  233  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 881 aa  233  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 481 aa  232  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 481 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  34.14 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 474 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 473 aa  229  5e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1094  glutamyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 464 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.634439  normal  0.0937945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 485 aa  229  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1609  glutamyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 483 aa  228  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 463 aa  227  4e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 481 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 470 aa  226  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 496 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 474 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 469 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 469 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 469 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 469 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>