More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0884 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  80.23 
 
 		 441 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  79.32 
 
 		 441 aa  693    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  72.34 
 
 		 441 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  79.09 
 
 		 441 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 441 aa  890    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  72.18 
 
 		 440 aa  605  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 449 aa  607  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 449 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 449 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  48.74 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 443 aa  388  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  49.43 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 444 aa  382  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 440 aa  351  1e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 472 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 485 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  36.16 
 
 		 518 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 477 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 488 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 508 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 464 aa  249  6e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 482 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 465 aa  249  8e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 469 aa  242  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 488 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 482 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 475 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 466 aa  236  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 481 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 		 498 aa  233  5e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 481 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 486 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 469 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 492 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0737  glutamyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.578074  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 483 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 496 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 468 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 468 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 478 aa  226  6e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 469 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 469 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 469 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 469 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0717  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.213331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 485 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 483 aa  224  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1642  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000802053  normal  0.126608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 469 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 481 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 469 aa  223  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 466 aa  222  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 504 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 504 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 468 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 504 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 463 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>