More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0429 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 443 aa  894    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  55.45 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  49.1 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 447 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 443 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 447 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 433 aa  299  5e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 477 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 465 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 465 aa  253  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 482 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  34.22 
 
 		 518 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 481 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 486 aa  237  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 481 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 498 aa  236  9e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 		 484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 		 484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 468 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 477 aa  232  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 467 aa  231  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 509 aa  230  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 481 aa  229  5e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 490 aa  229  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 881 aa  229  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 474 aa  229  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 494 aa  229  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 495 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 474 aa  227  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 469 aa  226  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 474 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 469 aa  226  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 		 469 aa  226  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 478 aa  226  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 474 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 469 aa  224  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 485 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>