More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2098 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  86 
 
 
457 aa  785    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  86.21 
 
 
459 aa  788    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
457 aa  933    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  72.65 
 
 
456 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 
456 aa  585  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 
449 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 
449 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 
449 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 
450 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 
446 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
453 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 
447 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  54.42 
 
 
445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  58.41 
 
 
458 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 
449 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 
447 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
441 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
449 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
441 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
441 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
441 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 
440 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
441 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
443 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
442 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
440 aa  389  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
443 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 
444 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
444 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
439 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
443 aa  379  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
443 aa  375  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
433 aa  297  3e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
481 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
472 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
881 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
481 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
477 aa  253  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
483 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
488 aa  246  6.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
481 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
488 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
485 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
479 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
481 aa  242  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
482 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
483 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
512 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
508 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
482 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
465 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
486 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
478 aa  239  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
482 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
465 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
478 aa  237  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
469 aa  236  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
469 aa  236  9e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 
463 aa  232  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
469 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
485 aa  232  9e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
463 aa  232  9e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
469 aa  232  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
464 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
468 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
469 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 
486 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
491 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
469 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
468 aa  230  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
481 aa  230  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
484 aa  230  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
504 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
469 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
469 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
488 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
504 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
469 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
504 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 
484 aa  229  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
477 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 
469 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
469 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
483 aa  229  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 
484 aa  229  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
469 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
470 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
471 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
464 aa  228  2e-58  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
492 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>