More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2388 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2388  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3027  glutamate--tRNA ligase  55.4 
 
 
278 aa  316  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  0.390374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  49.45 
 
 
323 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  50.18 
 
 
323 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  50.18 
 
 
323 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  45.59 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  51.48 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  47.58 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.26 
 
 
334 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  45.36 
 
 
330 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
329 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  42.68 
 
 
373 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
468 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
472 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.07 
 
 
303 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  41.11 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
478 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  38.75 
 
 
311 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  36.55 
 
 
546 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.36 
 
 
313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
482 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
508 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1690  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
468 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
469 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
504 aa  169  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
469 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 
469 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
466 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
498 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
469 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
469 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
469 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
469 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
535 aa  165  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.87 
 
 
299 aa  165  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1642  glutamyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000802053  normal  0.126608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.65 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
471 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2681  glutamyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
462 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
469 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
481 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  41.04 
 
 
314 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
494 aa  162  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
469 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
318 aa  162  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3370  glutamyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
477 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0214607  normal  0.182767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
469 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
480 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
469 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
469 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
469 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3110  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  40.36 
 
 
284 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0950  glutamyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
468 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
501 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
475 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1609  glutamyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
462 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
492 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
469 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
466 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
495 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
478 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
512 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
496 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  40.15 
 
 
302 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1094  glutamyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
464 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.634439  normal  0.0937945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
472 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4079  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  40.49 
 
 
281 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
464 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
469 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.13 
 
 
495 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3652  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.01 
 
 
288 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
484 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
509 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
467 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
468 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
468 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  40.78 
 
 
311 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
473 aa  156  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
465 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2734  glutamyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
469 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
467 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  36.78 
 
 
303 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  38.54 
 
 
287 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2500  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.72 
 
 
294 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0894  glutamyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
468 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.101678  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
525 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
500 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
465 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.93 
 
 
277 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.62 
 
 
296 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  37.41 
 
 
518 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>