99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2096 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  100 
 
 		 359 aa  731    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  67.96 
 
 		 364 aa  514  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  68.96 
 
 		 383 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  68.6 
 
 		 362 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  68.32 
 
 		 380 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  70.81 
 
 		 386 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  67.12 
 
 		 364 aa  494  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  68.77 
 
 		 365 aa  497  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  64.85 
 
 		 385 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  52.22 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  54.89 
 
 		 374 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  48.07 
 
 		 367 aa  345  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  48.21 
 
 		 413 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  49.59 
 
 		 398 aa  332  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  48.64 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  48.64 
 
 		 398 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  49.72 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  47.66 
 
 		 411 aa  326  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  48.62 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  45.28 
 
 		 382 aa  299  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  43.73 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  43.67 
 
 		 382 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  43.44 
 
 		 398 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 379 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  42.59 
 
 		 380 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  42.59 
 
 		 380 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  43.47 
 
 		 379 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  43.23 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  43.23 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  43.23 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  43.23 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  43.57 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  43.57 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  43.57 
 
 		 418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  41.4 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  41.4 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  41.4 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  42.03 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  40.7 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  40.97 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  37.82 
 
 		 401 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  37.72 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  37.72 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  37.72 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  37.88 
 
 		 403 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  37.76 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  36.55 
 
 		 408 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.96 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.96 
 
 		 402 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  36.29 
 
 		 410 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  36.29 
 
 		 408 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  36.29 
 
 		 401 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  36.29 
 
 		 408 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  36.29 
 
 		 408 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  36.29 
 
 		 408 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  37.56 
 
 		 411 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  36.46 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  36.06 
 
 		 410 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  36.19 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  35.59 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  35.59 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  30.7 
 
 		 388 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  29.89 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  26.27 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  28.98 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  29.26 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  27.03 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  25.45 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  28.99 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  25.19 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  24.61 
 
 		 373 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  24.48 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  24.48 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  23.14 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  24.09 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  24.92 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  23.17 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2197  hypothetical protein  32.48 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  22.98 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1690  hypothetical protein  23.01 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1551  hypothetical protein  24.73 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  20.57 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  22.44 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  22.76 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  22.76 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2378  lipoprotein  28.44 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  22.49 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  21.59 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03186  lipoprotein  27.37 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1737  lipoprotein  26.61 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  22.6 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  21.95 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  19.42 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  26.92 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  21.29 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  19.74 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1305  hypothetical membrane spanning protein  27.03 
 
 		 197 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  29.17 
 
 		 367 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1364  putative lipoprotein  27.03 
 
 		 197 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0274081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>