92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2004 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  93.96 
 
 		 381 aa  740    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  94.49 
 
 		 381 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  100 
 
 		 380 aa  776    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  93.96 
 
 		 381 aa  740    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  82.94 
 
 		 380 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  92.65 
 
 		 381 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  82.94 
 
 		 380 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  83.2 
 
 		 380 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  83.2 
 
 		 380 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  82.94 
 
 		 380 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  83.2 
 
 		 418 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  82.94 
 
 		 380 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  93.96 
 
 		 381 aa  740    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  100 
 
 		 380 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  83.2 
 
 		 418 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  72.66 
 
 		 382 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  73.49 
 
 		 379 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  72.18 
 
 		 379 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  43.01 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  43.27 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  43.01 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  39.51 
 
 		 411 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  39.14 
 
 		 413 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  39.95 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  39.3 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  42.53 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  39.79 
 
 		 364 aa  263  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  38.44 
 
 		 381 aa  255  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  38.5 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  39.73 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  41.32 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  40.6 
 
 		 367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  39.14 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  40.97 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  39.14 
 
 		 380 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  40.97 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  36.7 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  38.04 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  38.81 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  36.27 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 410 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 408 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 408 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 408 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.18 
 
 		 402 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  36.36 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.18 
 
 		 402 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  33.88 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  37 
 
 		 401 aa  215  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  35.93 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  35.93 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  35.93 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  35.14 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  35.09 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  33.33 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  32.73 
 
 		 379 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  30.64 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  30.64 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  32.19 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  27.07 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  26.4 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  25.2 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  25.65 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  26.06 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  25.25 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  24.69 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  26.88 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  24.07 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  23.12 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  23.51 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  24.01 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  23.51 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  23.89 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  23.64 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  24.6 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  23.4 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  22.19 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  22.19 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  21.74 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  22.99 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  21.36 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2197  hypothetical protein  26.61 
 
 		 199 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  22.19 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  22.37 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  22.88 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  22.88 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  22.88 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1690  hypothetical protein  27.7 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1551  hypothetical protein  22.39 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>