92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1004 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  92.79 
 
 		 401 aa  732    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  80.2 
 
 		 401 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  100 
 
 		 402 aa  824    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  94.03 
 
 		 402 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  95.53 
 
 		 403 aa  749    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  100 
 
 		 402 aa  824    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  94.78 
 
 		 402 aa  757    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  80.2 
 
 		 408 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  80.45 
 
 		 401 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  80.2 
 
 		 408 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  80.69 
 
 		 408 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  80.45 
 
 		 408 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  80.2 
 
 		 408 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  100 
 
 		 402 aa  824    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  80.2 
 
 		 410 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  70.98 
 
 		 410 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  69.59 
 
 		 411 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  70.39 
 
 		 409 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  40.7 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  40.45 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  40.45 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  40.81 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  38.07 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  38.73 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  35.79 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  36.46 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  36.13 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  36.46 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  36.5 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  34.77 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  37.08 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  35.26 
 
 		 374 aa  229  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  38.8 
 
 		 359 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  35.77 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  35.21 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  36.62 
 
 		 365 aa  226  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  36.68 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  36.84 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  36.84 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  33.42 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  34.96 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  35.43 
 
 		 381 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  35.43 
 
 		 381 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  35.43 
 
 		 381 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  35.43 
 
 		 381 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  37.58 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  35.84 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  34.87 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  34.87 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  33.84 
 
 		 379 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  37.9 
 
 		 418 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  37.37 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  36.18 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  35.84 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  28.33 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  29.21 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  29.21 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  27.39 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  23.95 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  27.6 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  27.27 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  32.61 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  21.97 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  21.59 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  21.59 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  22.1 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  22.96 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  22.8 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  23.17 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  22.49 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  22.94 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  22.68 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  21.17 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  21.29 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  20.51 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  23.97 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  23.97 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  23.66 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  21.43 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  23.19 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1551  hypothetical protein  21.96 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  22.14 
 
 		 365 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  20.66 
 
 		 365 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  21.43 
 
 		 365 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  22.9 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2197  hypothetical protein  24.39 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  24.05 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  32.08 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>