100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2621 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  809    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  28.88 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  30.41 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  29.06 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  30.12 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  28.44 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  28.97 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  29.81 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  29.81 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  26.87 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  25.88 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  24.44 
 
 		 412 aa  92.8  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  24.44 
 
 		 412 aa  92.8  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  23.24 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1690  hypothetical protein  22.87 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  23.19 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  24.38 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  22.35 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  24.02 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  24.69 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  23.97 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  23.89 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2815  hypothetical protein  23.42 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  22.7 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  22.54 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  22.04 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  21.38 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  22.87 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  21.64 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  25.23 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  24.28 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  21.46 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  21.98 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  24.28 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  22.99 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  22.32 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  23.11 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  23.45 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  23.45 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  23.45 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  25.56 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  24.78 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  20.63 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  23.01 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  22.5 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  22.5 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  22.76 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  24.49 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  24.49 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  21.38 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  21.53 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  21.38 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  20.5 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  25.83 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  21.07 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  21.07 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  21.07 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  21.07 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  21.67 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  25.96 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  22.41 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  21.78 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  21.67 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  21.67 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  21.52 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  21.67 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3699  lipoprotein  22.74 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  21.67 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02331  hypothetical protein  22.74 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  27.86 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  18.75 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1192  NlpBDapX family lipoprotein  22.74 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2624  lipoprotein  22.74 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  27.86 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1199  lipoprotein  22.74 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2759  lipoprotein  22.74 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2609  lipoprotein  22.74 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  27.86 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02369  lipoprotein  22.74 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2849  lipoprotein  22.92 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  23.85 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2854  lipoprotein  23.84 
 
 		 344 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1073  lipoprotein  20.75 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2722  lipoprotein  23.51 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2747  lipoprotein  23.51 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2681  lipoprotein  23.51 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2633  lipoprotein  23.51 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2973  lipoprotein  22.07 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.500746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  21.7 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  21.7 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  21.7 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  22.5 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  20.6 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  20.6 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  21.88 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  22.99 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  24.29 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>