115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5090 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  100 
 
 
385 aa  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  68.68 
 
 
362 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  67.47 
 
 
380 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  67.51 
 
 
364 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  64.87 
 
 
365 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  62.77 
 
 
364 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  64.96 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  60.05 
 
 
383 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  61.94 
 
 
386 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  47.96 
 
 
413 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  52.23 
 
 
389 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  46.97 
 
 
411 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  49.87 
 
 
398 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  48.79 
 
 
398 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  48.79 
 
 
398 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  50.27 
 
 
367 aa  340  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  51.98 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  49.59 
 
 
381 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  49.58 
 
 
374 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  43.9 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  43.4 
 
 
381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  42.82 
 
 
398 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  40.97 
 
 
382 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  42.61 
 
 
380 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  42.61 
 
 
380 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  42.61 
 
 
380 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  42.61 
 
 
380 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  42.32 
 
 
418 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  42.32 
 
 
380 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  42.32 
 
 
380 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  42.3 
 
 
379 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  41.57 
 
 
418 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  42.02 
 
 
379 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  40.7 
 
 
381 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  40.7 
 
 
381 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  40.7 
 
 
381 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  38.93 
 
 
380 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  38.93 
 
 
380 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  39.62 
 
 
381 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  39.62 
 
 
381 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  34.53 
 
 
411 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  34.06 
 
 
409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  35.97 
 
 
401 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  34.73 
 
 
401 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  36.04 
 
 
402 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.04 
 
 
402 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.04 
 
 
402 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  35.11 
 
 
402 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  33.73 
 
 
408 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  33.73 
 
 
408 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  33.73 
 
 
408 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  33.73 
 
 
408 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  33.73 
 
 
410 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  34.15 
 
 
401 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  33.98 
 
 
408 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  35.11 
 
 
402 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  36.04 
 
 
403 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  33.82 
 
 
410 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  37.37 
 
 
379 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  34.56 
 
 
412 aa  202  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  34.56 
 
 
412 aa  202  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  30.81 
 
 
388 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  30.39 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  29.06 
 
 
338 aa  133  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  26.41 
 
 
396 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  26.67 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  27.15 
 
 
373 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  25.89 
 
 
371 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  26.21 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  25.71 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  26.17 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  25.71 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  25.91 
 
 
372 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  25.19 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  22.93 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  21.85 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  23.1 
 
 
375 aa  67  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  20.26 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  21.73 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  21.73 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1551  hypothetical protein  22.52 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  21.99 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  20.47 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2197  hypothetical protein  29.57 
 
 
199 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  21.99 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  21.36 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  21.89 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  22.14 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  20.21 
 
 
365 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  20.21 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  20.21 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  31.58 
 
 
368 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  22.4 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  20.62 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  27.1 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  21.14 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1305  hypothetical membrane spanning protein  27.93 
 
 
197 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.176822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  27.27 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1364  putative lipoprotein  27.35 
 
 
197 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0274081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  26.53 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>