88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2523 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  100 
 
 		 338 aa  693    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  33.51 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  31.16 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  30.89 
 
 		 367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  28.54 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  28.49 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  28.8 
 
 		 385 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  27.97 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  27.7 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  27.79 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  27.7 
 
 		 398 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  28.73 
 
 		 364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  27.76 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  27.99 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  28.53 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  27.78 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 382 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  27.06 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  27.07 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  27.07 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  28.33 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  26.3 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  26.58 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  25 
 
 		 379 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  25.2 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  25.2 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  24.4 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  25.99 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  25.27 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  25.99 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  25.68 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  25.99 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  25.54 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  25 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  27.01 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  25.34 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  25.49 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  28.93 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  25 
 
 		 410 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  25 
 
 		 408 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  25 
 
 		 408 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  25 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  25 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  25 
 
 		 408 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  24.76 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  35.53 
 
 		 346 aa  85.9  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  37.17 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  33.33 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  33.33 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  33.33 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  36.94 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.94 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  35.2 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  34.27 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  33.09 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  24.38 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  24.1 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  36.28 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  25.34 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  24.19 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  24.73 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  24 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  25.34 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  22.44 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  23.71 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  24.35 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  26.11 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2197  hypothetical protein  32 
 
 		 199 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  30.23 
 
 		 370 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2815  hypothetical protein  23.37 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  32.71 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0672  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0143401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1690  hypothetical protein  21.45 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  30.68 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  28.42 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  27.27 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  21.8 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  27.27 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  27.27 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  34.57 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>