41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1690 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1690  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  736    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  28.49 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  27.22 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  24.78 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  26.06 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  26.06 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  25 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  25.98 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  26.48 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  24.5 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  23.85 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  24.32 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2815  hypothetical protein  25.8 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  22.9 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  23.26 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  24.72 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  23.26 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  25.86 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  25.26 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  24.38 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  20.94 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  23.5 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  27.37 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  24.06 
 
 		 398 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  25 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  25.64 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  24.72 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  23.75 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  22.33 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  19.88 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  28.78 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  28.78 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  28.78 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  22.06 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  21.15 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  27.7 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  24.04 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  27.7 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  22.51 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  28.77 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 382 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>