88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0990 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  81.41 
 
 		 381 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  100 
 
 		 382 aa  795    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  45.95 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  45.7 
 
 		 398 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  46.95 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  42.93 
 
 		 411 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  43.18 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  46.78 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  43.9 
 
 		 385 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  46.24 
 
 		 365 aa  296  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  42.78 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  46.87 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  46.87 
 
 		 380 aa  292  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  43.98 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  45.53 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  44.89 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  40.94 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  43.5 
 
 		 374 aa  276  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  43.48 
 
 		 374 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  43.8 
 
 		 381 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  40.46 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  37.77 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  37.77 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  37.77 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 418 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 418 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  37.8 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  36.97 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  38.7 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  36.7 
 
 		 381 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  37.85 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  36.7 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  36.7 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.46 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.46 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  36.04 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  35.89 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.04 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  36.04 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  34.88 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  35.62 
 
 		 401 aa  225  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  34.24 
 
 		 403 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  34.61 
 
 		 408 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  34.86 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  34.86 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  34.86 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  34.86 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  34.86 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  34.86 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  33.25 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  32.52 
 
 		 410 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  35.23 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  33.08 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  30.6 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  30.6 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  30.4 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  27.78 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  29.84 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  29.84 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  26.25 
 
 		 346 aa  109  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  26.28 
 
 		 373 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  24.15 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  26.73 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  24.28 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  23.91 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  25.65 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  28.68 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  25.99 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  25.43 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  21.61 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  21.88 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  20.76 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  21.19 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  21.14 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  21.77 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2197  hypothetical protein  27.12 
 
 		 199 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  21.91 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  23.3 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0672  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0143401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1690  hypothetical protein  24.04 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  27.72 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>