87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0828 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  100 
 
 		 379 aa  746    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  39.24 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  37.98 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  37.98 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  39.29 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  37.37 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  37.14 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  38.66 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  37.57 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  36.31 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  35.66 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  36.36 
 
 		 364 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  35.51 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  35.51 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  35.51 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  36.74 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  35.04 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  36.69 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  37.6 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  33 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  33.51 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  32.33 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  33.5 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  32.73 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  32.19 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  32.73 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  32.38 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  32.38 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  32.38 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  31.97 
 
 		 418 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  32.29 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  35.23 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  32.38 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  31.61 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  31.46 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  31.46 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  31.46 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  31.2 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  31.2 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  31.28 
 
 		 418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  31.2 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  31.2 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  29.45 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  28.5 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  28.5 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  29.85 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  29.12 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  28.5 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  29.76 
 
 		 401 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  27.76 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  28.28 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  27.5 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  28.28 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  31.9 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  31.9 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  30.05 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  29.49 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  29.15 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  29.5 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  28.63 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  27.15 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  24.94 
 
 		 372 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  24.81 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  25.64 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  25.13 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  25.19 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  25.43 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  24.03 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  25.77 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1551  hypothetical protein  21.99 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  18.75 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1991  hypothetical protein  23.41 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.138166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2357  lipoprotein, putative  23.41 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  22.31 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  24.22 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  22.19 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  21.24 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  23.56 
 
 		 368 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  21.24 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  21.24 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>