40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1551 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1551  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  815    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633528  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  25.09 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  23 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  22.01 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  24.39 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  23.46 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  22.55 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  21.45 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  23.87 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  24.62 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  24.62 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  25.24 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  24.54 
 
 		 359 aa  50.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  22.75 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  23.74 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  21.96 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  22.3 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  21.35 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  21.96 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  24.12 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  21.96 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  23.9 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  21.96 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  21.96 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  21.96 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  23.51 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  23.41 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  23.51 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  23.51 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  23.51 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  23.51 
 
 		 408 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  23.51 
 
 		 408 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  24.65 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  22.02 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  22.02 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  24.7 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  22.68 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  22.58 
 
 		 410 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  22.39 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  22.39 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>