102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1105 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  100 
 
 		 411 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  82.21 
 
 		 413 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  60 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  60.24 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  58.61 
 
 		 398 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  48.55 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  46.97 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  49.35 
 
 		 386 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  47.42 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  47.42 
 
 		 380 aa  332  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  46.61 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  44.31 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  47.3 
 
 		 374 aa  322  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  48.92 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  43.86 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  44.79 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  42.79 
 
 		 381 aa  313  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  46.17 
 
 		 374 aa  309  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  46.9 
 
 		 389 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  45.64 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  44.22 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  41.16 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  40.49 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  40.49 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  39.9 
 
 		 379 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  38.93 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  38.93 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  38.93 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  39.66 
 
 		 381 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  38.7 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  40.15 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  38.69 
 
 		 381 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  40.98 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  40.98 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  40.98 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  40.98 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  40.98 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  40.98 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  40.88 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  40.14 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  40.98 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  38.05 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  40.63 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  40.63 
 
 		 401 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  40.63 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  40.63 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  40.63 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  38.41 
 
 		 409 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  39.79 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  39.66 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  39.66 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  40.35 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  39.66 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  41.45 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  39.47 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  38.61 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  38.7 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  38.7 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  32.59 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  32.79 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  32.79 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  27.39 
 
 		 346 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  28.75 
 
 		 338 aa  123  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  26.6 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  26.6 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  27.04 
 
 		 373 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  26.15 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  26.95 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  26.62 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  24.76 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  23.18 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  25.4 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  23.83 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  24.56 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  25.97 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  23.54 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  21.53 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  25.32 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  23.45 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  23.45 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  23.99 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  22.94 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  22.88 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  22.94 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  22.94 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  23 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  22.48 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  22.31 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  22.96 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2197  hypothetical protein  30.33 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  22.78 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  21.2 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1305  hypothetical membrane spanning protein  32.48 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.176822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  21.01 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1364  putative lipoprotein  31.62 
 
 		 197 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0274081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  21.09 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1551  hypothetical protein  21.35 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  23.59 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0672  putative lipoprotein  28.46 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0143401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>