24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1305 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1305  hypothetical membrane spanning protein  100 
 
 
197 aa  401  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.176822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1364  putative lipoprotein  99.49 
 
 
197 aa  398  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0274081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  32.48 
 
 
411 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  26.83 
 
 
372 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  30.77 
 
 
413 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  26.02 
 
 
372 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  27.93 
 
 
385 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  31.43 
 
 
386 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  22.3 
 
 
346 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  24.81 
 
 
371 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  25.37 
 
 
372 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  26.61 
 
 
398 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  25.81 
 
 
398 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  26.87 
 
 
373 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  25.37 
 
 
373 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  26.87 
 
 
373 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  26.61 
 
 
398 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  24.06 
 
 
373 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  29.52 
 
 
383 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  31.48 
 
 
364 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  26.92 
 
 
380 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  26.92 
 
 
362 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  26.05 
 
 
365 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  28.04 
 
 
359 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>