90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1409 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1770  uncharacterized lipoprotein-like protein  90.55 
 
 
401 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.402849  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  99.25 
 
 
402 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  94.78 
 
 
402 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  94.78 
 
 
402 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  79.7 
 
 
408 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  79.7 
 
 
408 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  79.95 
 
 
408 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  79.7 
 
 
408 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  79.7 
 
 
408 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  79.95 
 
 
401 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  94.78 
 
 
402 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  92.8 
 
 
403 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  100 
 
 
402 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  79.7 
 
 
401 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  79.7 
 
 
410 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1444  putative exported lipoprotein  70.8 
 
 
411 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210161  normal  0.0324872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  71.88 
 
 
410 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2676  putative exported lipoprotein  70.39 
 
 
409 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439615  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  40.45 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  40.2 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  40.2 
 
 
398 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  40.3 
 
 
413 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  38.22 
 
 
411 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  37.35 
 
 
383 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  35.95 
 
 
382 aa  239  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  35.44 
 
 
364 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  35.31 
 
 
382 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  35.95 
 
 
362 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  34.79 
 
 
381 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  35.62 
 
 
385 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  36.88 
 
 
365 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  35.95 
 
 
380 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  34.76 
 
 
374 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  37.5 
 
 
359 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  37.34 
 
 
364 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  35.48 
 
 
379 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  36.22 
 
 
386 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  37.19 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  37.19 
 
 
380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  36.59 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  35.68 
 
 
381 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  35.68 
 
 
381 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  35.68 
 
 
381 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  35.03 
 
 
379 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  36.43 
 
 
381 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  33.17 
 
 
367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  35.18 
 
 
381 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  37.26 
 
 
418 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  34.62 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  34.62 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  34.62 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  34.36 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  34.36 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  34.36 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  34.36 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  36.34 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  36.18 
 
 
398 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  35.06 
 
 
389 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  27.83 
 
 
379 aa  146  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  28.76 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  28.76 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  27.73 
 
 
388 aa  126  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2475  NlpBDapX lipoprotein  23.7 
 
 
346 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  27.27 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  27.6 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  32.61 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  21.27 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  20.5 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  20.44 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  21.29 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  22.84 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  22.84 
 
 
373 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  22.48 
 
 
375 aa  59.7  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  22.42 
 
 
373 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  21.1 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  20.74 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  23.3 
 
 
373 aa  53.1  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  28.47 
 
 
370 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  23.36 
 
 
395 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  21.17 
 
 
371 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2197  hypothetical protein  25.61 
 
 
199 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  19.79 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  20 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1551  hypothetical protein  21.96 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  19.79 
 
 
365 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  22.36 
 
 
368 aa  46.6  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  23.42 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  23.42 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  35.71 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  19.01 
 
 
365 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>