69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1981 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  100 
 
 		 365 aa  740    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  67.38 
 
 		 373 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  67.02 
 
 		 371 aa  531  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  65.51 
 
 		 373 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  60.11 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  59.56 
 
 		 365 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  60.93 
 
 		 365 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  59.29 
 
 		 365 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  59.29 
 
 		 365 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  60.11 
 
 		 365 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  59.84 
 
 		 365 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  60.11 
 
 		 365 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  57.65 
 
 		 365 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  57.65 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  57.22 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  55.37 
 
 		 354 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  30.66 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  26.8 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2973  lipoprotein  24.93 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.500746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1861  NlpB/DapX family lipoprotein  23.18 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127123  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3508  lipoprotein  23.23 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2759  lipoprotein  23.99 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2609  lipoprotein  23.99 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1192  NlpBDapX family lipoprotein  23.99 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1199  lipoprotein  23.99 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2624  lipoprotein  23.99 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02331  hypothetical protein  23.99 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02369  lipoprotein  23.99 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1140  lipoprotein  25.65 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3699  lipoprotein  23.99 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3182  putative lipoprotein  23.47 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0809995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2378  lipoprotein  27.72 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2854  lipoprotein  23.7 
 
 		 344 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2849  lipoprotein  23.41 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2681  lipoprotein  23.12 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2747  lipoprotein  23.12 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2722  lipoprotein  23.12 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2633  lipoprotein  23.12 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  25.57 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1073  lipoprotein  24.29 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3133  lipoprotein  24.36 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1363  lipoprotein  24.29 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.206221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1248  lipoprotein  24.36 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1737  lipoprotein  27.17 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  23.77 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002794  NlpB lipoprotein component of the protein assembly complex  25 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0847  NlpBDapX lipoprotein  25.31 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03186  lipoprotein  23.38 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  22.63 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  21.37 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  24.27 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  21.89 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  23.82 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  25.97 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  22.36 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  22.36 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  22.87 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  22.31 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  23.35 
 
 		 386 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  22.31 
 
 		 362 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  21.7 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  21.77 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  22.02 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  19.95 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1690  hypothetical protein  19.88 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  23.61 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  21.02 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  19.76 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  20.3 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>