60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0672 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0672  putative lipoprotein  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0143401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1146  hypothetical protein  31.06 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0438045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  29.23 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1084  NlpBDapX family lipoprotein  29.81 
 
 		 398 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0988  NlpBDapX family lipoprotein  29.81 
 
 		 398 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359862  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  31.15 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0848  NlpB/DapX family lipoprotein  28.79 
 
 		 381 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.733963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  26.83 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1586  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 379 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2564  putative transmembrane protein  33.7 
 
 		 389 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  31.71 
 
 		 411 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  26.47 
 
 		 365 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2697  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 418 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1452  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 380 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.477634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3138  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 380 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1677  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 380 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2179  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 380 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  25.9 
 
 		 338 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2618  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 380 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2564  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 380 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.601002  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2004  NlpB/DapX family lipoprotein  30 
 
 		 380 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.547215  decreased coverage  0.00000000202263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2131  NlpB/DapX family lipoprotein  30 
 
 		 380 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598239  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2547  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 379 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00204284  normal  0.0198608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  30.63 
 
 		 418 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  28.3 
 
 		 385 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  28.21 
 
 		 383 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 382 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  32.03 
 
 		 381 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5400  uncharacterized lipoprotein  30.63 
 
 		 381 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00915986  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  27.27 
 
 		 386 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  26.97 
 
 		 396 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  29.66 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  27.63 
 
 		 396 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0828  NlpB/DapX family lipoprotein  32.94 
 
 		 379 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2578  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 401 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0891208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1749  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 408 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1080  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 410 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1905  hypothetical protein  25.89 
 
 		 401 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0976  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 408 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1726  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 408 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0190  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 408 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1524  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 408 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  24.55 
 
 		 362 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  24.55 
 
 		 380 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5983  uncharacterized lipoprotein  28.83 
 
 		 381 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.234515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2112  uncharacterized lipoprotein  28.83 
 
 		 381 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267901  hitchhiker  0.00841368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  23.77 
 
 		 371 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2094  uncharacterized lipoprotein  28.83 
 
 		 381 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  26.77 
 
 		 370 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1523  putative exported lipoprotein  25.96 
 
 		 410 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.196689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2641  NlpB/DapX family lipoprotein  32.5 
 
 		 398 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  28.97 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0409  putative lipoprotein  33.01 
 
 		 388 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.961142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1462  uncharacterized lipoprotein-like protein  32.1 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2197  hypothetical protein  25.47 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1486  uncharacterized lipoprotein-like protein  32.1 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.749081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1004  uncharacterized lipoprotein-like  32.1 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4626  uncharacterized lipoprotein-like  32.35 
 
 		 403 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1409  uncharacterized lipoprotein-like protein  32.1 
 
 		 402 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1369  uncharacterized lipoprotein-like protein  32.1 
 
 		 402 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>