28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2815 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2815  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.130098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3974  lipoprotein  27.76 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4180  lipoprotein  28.23 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1268  hypothetical protein  27.76 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.566697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1238  putative lipoprotein  27.76 
 
 		 373 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.906689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3952  lipoprotein, putative  25.27 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1549  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.428781  normal  0.0328405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35330  lipoprotein  26.32 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1372  putative lipoprotein  24.47 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1690  hypothetical protein  25.8 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51260  hypothetical protein  24.41 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4386  hypothetical protein  24.41 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1664  hypothetical protein  24.13 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2621  hypothetical protein  23.91 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0986  uncharacterized lipoprotein  28.67 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00100518  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0842  uncharacterized lipoprotein  28.67 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00443208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  27.97 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2523  NlpB/DapX lipoprotein  23.15 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3006  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1539  NlpBDapX lipoprotein  29.06 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  22.22 
 
 		 364 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1907  putative lipoprotein  25.27 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0149  hypothetical protein  26.44 
 
 		 111 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000121716  hitchhiker  0.0000266378 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0159  hypothetical protein  26.44 
 
 		 111 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00439449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1426  putative lipoprotein  23.12 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.600004  normal  0.242531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  26.32 
 
 		 365 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1180  uncharacterized lipoprotein  22.57 
 
 		 381 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  hitchhiker  0.0000123532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0679  lipoprotein  44.9 
 
 		 375 aa  42.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.826541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>