59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2378 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2378  lipoprotein  100 
 
 		 350 aa  715    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1737  lipoprotein  59.17 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002794  NlpB lipoprotein component of the protein assembly complex  56.75 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03186  lipoprotein  57.98 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2759  lipoprotein  33.83 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02331  hypothetical protein  33.83 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3699  lipoprotein  33.83 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2624  lipoprotein  33.83 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1199  lipoprotein  33.83 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02369  lipoprotein  33.83 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2609  lipoprotein  33.83 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1192  NlpBDapX family lipoprotein  33.83 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2633  lipoprotein  33.53 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2722  lipoprotein  33.53 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2747  lipoprotein  33.53 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2681  lipoprotein  33.53 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2854  lipoprotein  33.23 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3508  lipoprotein  33.04 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2973  lipoprotein  33.73 
 
 		 344 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.500746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2849  lipoprotein  32.93 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1073  lipoprotein  33.43 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1140  lipoprotein  32.63 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  32.44 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  32.54 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3133  lipoprotein  32.22 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1248  lipoprotein  32.22 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1363  lipoprotein  32.42 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.206221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  24.18 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  29.76 
 
 		 373 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  29.72 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  28.25 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  27.22 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  28.03 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  29.56 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  27.7 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  27.7 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  25.69 
 
 		 367 aa  99.8  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  28.45 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  29.38 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  27.42 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  27.42 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  27.42 
 
 		 365 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  26.39 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  26.39 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1861  NlpB/DapX family lipoprotein  25.87 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127123  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  27.72 
 
 		 365 aa  89.4  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1009  NlpB/DapX family lipoprotein  31.13 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0923  NlpBDapX family lipoprotein  31.13 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3182  putative lipoprotein  21.26 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0809995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1336  NlpB/DapX family lipoprotein  28.46 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3171  NlpBDapX lipoprotein  31.78 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1195  NlpB/DapX family lipoprotein  30.84 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.621133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1201  NlpB/DapX family lipoprotein  28.57 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3433  NlpBDapX family lipoprotein  29.82 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2096  NlpBDapX lipoprotein  28.44 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0054161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5090  NlpB/DapX family lipoprotein  25.93 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1069  hypothetical protein  30.93 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1105  transmembrane protein  28.42 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0990  NlpBDapX family lipoprotein  29.37 
 
 		 382 aa  42.7  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000475285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>