47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1248 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1363  lipoprotein  99.72 
 
 		 352 aa  711    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.206221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3133  lipoprotein  99.72 
 
 		 352 aa  712    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1248  lipoprotein  100 
 
 		 352 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3508  lipoprotein  72.21 
 
 		 350 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1140  lipoprotein  68.99 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  68.99 
 
 		 345 aa  481  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1073  lipoprotein  63.58 
 
 		 346 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  63.01 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2973  lipoprotein  62.9 
 
 		 344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.500746 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1192  NlpBDapX family lipoprotein  62.61 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02331  hypothetical protein  62.61 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2854  lipoprotein  62.32 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2624  lipoprotein  62.61 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1199  lipoprotein  62.61 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2759  lipoprotein  62.61 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2609  lipoprotein  62.61 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02369  lipoprotein  62.61 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2633  lipoprotein  62.03 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2722  lipoprotein  62.03 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2747  lipoprotein  62.03 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2681  lipoprotein  62.03 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3699  lipoprotein  62.03 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2849  lipoprotein  62.03 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2378  lipoprotein  32.64 
 
 		 350 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03186  lipoprotein  29.7 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1737  lipoprotein  30.77 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002794  NlpB lipoprotein component of the protein assembly complex  30.3 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  28.8 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  29.05 
 
 		 365 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  27.81 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  27.83 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  27.81 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  27.53 
 
 		 365 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  28.44 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  28.44 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  28.44 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  28.13 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  26.45 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  26.94 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  26.52 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  25.22 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  24.19 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  23.56 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  21.98 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  20.79 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3182  putative lipoprotein  22.4 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0809995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1861  NlpB/DapX family lipoprotein  21.07 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127123  normal  0.13379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>