71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6307 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6307  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  100 
 
 		 317 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4846  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component  59.26 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512512  normal  0.113885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2510  putative signal peptide protein  52.13 
 
 		 338 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.419602  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  45.42 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5651  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  43.05 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0644  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  36.68 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.723339  normal  0.0766763 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0557  Extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1874  TRAP dicarboxylate transporter subunit DctP  23.15 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1777  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.8 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0643258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1377  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.75 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2077  TRAP dicarboxylate transporter subunit DctP  23.57 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.18454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2483  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.75 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0131179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2337  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.42 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1780  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.28 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258886  normal  0.0122239 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2044  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.73 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3098  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.38 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.528068 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3453  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4928  hypothetical protein  24.71 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.242757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3546  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.49 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3715  twin-arginine translocation pathway signal  23.84 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000597887  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3427  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.59 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1035  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.46 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.497545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1609  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.08 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3297  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.92 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1026  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.24 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.608774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5333  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.81 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2166  putative signal peptide protein  26.58 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2369  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.47 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.019871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1969  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.05 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1411  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134914  normal  0.071532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1774  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.9 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0356  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.18 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.547222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4505  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.29 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2479  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.33 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4619  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.33 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0114  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.69 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290706  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0034  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.53 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0556  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.38 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2569  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.13 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4868  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.08 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.332179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1089  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.81 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0631186  normal  0.345342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1471  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.95 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.662537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0570  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.92 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3084  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.29 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659506  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5883  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.87 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6123  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.87 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72683  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3620  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.6 
 
 		 363 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2794  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  21.05 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3764  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.86 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.289423  normal  0.209559 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6028  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.52 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648225  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5663  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.52 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0331  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6518  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.52 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7436  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  20.24 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2147  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.19 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2055  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0607  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.46 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.866976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3588  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  21.61 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565574  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1732  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.12 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2280  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.95 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2592  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.93 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00256887  normal  0.0517613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4429  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  20.91 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0487  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  23.13 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2138  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.13 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231468  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3612  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  20.44 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00839083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2485  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.32 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0992841  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1747  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.05 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2567  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.57 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  hitchhiker  0.00000000175996 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1647  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  21.53 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1873  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  21.77 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1774  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.96 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>