159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1023 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1023  co-chaperone HscB  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187887  normal  0.466989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0953  co-chaperone HscB  86.78 
 
 		 179 aa  308  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0888  co-chaperone HscB  86.21 
 
 		 179 aa  307  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1062  co-chaperone HscB  70.18 
 
 		 172 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1556  co-chaperone HscB  63.07 
 
 		 175 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336849  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1705  co-chaperone HscB  64.57 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2729  co-chaperone HscB  64.57 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2214  co-chaperone HscB  64.57 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2596  co-chaperone HscB  64.57 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2652  co-chaperone HscB  64.57 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1455  co-chaperone HscB  62.5 
 
 		 175 aa  223  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3106  co-chaperone HscB  64.91 
 
 		 172 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1486  co-chaperone HscB  64.91 
 
 		 172 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1878  co-chaperone HscB  64 
 
 		 175 aa  220  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.328354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2576  co-chaperone HscB  61.93 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.922422  hitchhiker  0.00128374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1028  co-chaperone HscB  65.7 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121779  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1147  co-chaperone HscB  65.71 
 
 		 175 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234201  normal  0.0862801 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5954  co-chaperone HscB  64.57 
 
 		 175 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2123  co-chaperone HscB  64.57 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2140  co-chaperone HscB  64.57 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2033  co-chaperone HscB  64 
 
 		 201 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2160  co-chaperone HscB  64 
 
 		 201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.726593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5429  co-chaperone HscB  63.43 
 
 		 175 aa  207  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1953  co-chaperone HscB  53.25 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00597172  normal  0.35074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1167  co-chaperone HscB  51.28 
 
 		 175 aa  157  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.104058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0805  co-chaperone Hsc20  44.89 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0526671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2202  co-chaperone HscB  50.89 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0251  co-chaperone HscB  46.82 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2141  co-chaperone Hsc20  52.69 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00840727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1641  co-chaperone Hsc20  52.69 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2145  co-chaperone Hsc20  47.06 
 
 		 172 aa  150  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186352  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0472  co-chaperone Hsc20  47.83 
 
 		 179 aa  150  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1490  co-chaperone Hsc20  45.06 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2180  co-chaperone Hsc20  46.86 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00471531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2287  co-chaperone Hsc20  46.55 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.198647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3996  co-chaperone Hsc20  46.29 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456652  normal  0.028593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2259  chaperone protein  46.84 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.334367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2181  co-chaperone Hsc20  45.24 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00609006  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1435  co-chaperone Hsc20  45.61 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.506311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2446  co-chaperone Hsc20  48.5 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1044  co-chaperone Hsc20  44.71 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1135  co-chaperone HscB  37.57 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0280  co-chaperone HscB  41.28 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0282071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2376  co-chaperone Hsc20  44.19 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.332037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1241  co-chaperone HscB  41.24 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0720  co-chaperone HscB  38.15 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3024  co-chaperone HscB  39.39 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0260581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2811  co-chaperone HscB  40 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.275401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02419  co-chaperone HscB  40 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1141  co-chaperone Hsc20  40 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3758  co-chaperone HscB  40 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00502648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1150  co-chaperone HscB  40 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2902  co-chaperone HscB  40 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.430469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2679  co-chaperone HscB  40 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02383  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2678  co-chaperone HscB  40 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2267  co-chaperone HscB  37.5 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2277  co-chaperone HscB  37.11 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1779  co-chaperone HscB  34.88 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000385415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2146  co-chaperone HscB  38.36 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000935401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004357  chaperone protein HscB  37.28 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01058  co-chaperone HscB  37.87 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1327  co-chaperone Hsc20  37.71 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1742  co-chaperone HscB  35.85 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2314  co-chaperone HscB  36.99 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.963474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1461  co-chaperone HscB  35.47 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1296  co-chaperone HscB  39.08 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0123344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1822  co-chaperone HscB  35.22 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0713219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2868  co-chaperone HscB  36.05 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  hitchhiker  0.0000000210214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2056  co-chaperone HscB  41.62 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0804061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2802  co-chaperone HscB  38.79 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1171  co-chaperone HscB  38.24 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0432  co-chaperone HscB  37.65 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1279  co-chaperone HscB  37.65 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0825  co-chaperone Hsc20  39.49 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484161  normal  0.641557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1426  co-chaperone Hsc20  35.47 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2499  co-chaperone HscB  36.48 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0105977  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0875  co-chaperone HscB  34.68 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0676  co-chaperone Hsc20  39.49 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3624  co-chaperone HscB  38.69 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.784226  normal  0.865317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0845  co-chaperone HscB  34.1 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1240  co-chaperone HscB  35.47 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1107  co-chaperone HscB  36.9 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0928477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3028  co-chaperone HscB  40.38 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0640  co-chaperone Hsc20  45.97 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474346  normal  0.400649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2748  co-chaperone HscB  40.38 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4609  co-chaperone HscB  34.71 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2394  co-chaperone HscB  35.85 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00154498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40370  co-chaperone HscB  35.88 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2383  co-chaperone HscB  35.22 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000460884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1491  co-chaperone HscB  36 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1964  co-chaperone HscB  35.22 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0595  co-chaperone Hsc20  45.76 
 
 		 205 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0888  co-chaperone HscB  33.53 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2421  co-chaperone HscB  34.68 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0621  co-chaperone Hsc20  44.92 
 
 		 205 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.567041  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0630  co-chaperone Hsc20  44.92 
 
 		 205 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4333  co-chaperone HscB  34.3 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.147193  hitchhiker  0.000000000185961 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2739  co-chaperone HscB  38.18 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2780  co-chaperone HscB  38.18 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.783416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>