119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1044 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1044  co-chaperone Hsc20  100 
 
 		 172 aa  340  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1435  co-chaperone Hsc20  67.25 
 
 		 172 aa  236  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.506311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2259  chaperone protein  67.44 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.334367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1641  co-chaperone Hsc20  60.69 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2141  co-chaperone Hsc20  60.69 
 
 		 172 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00840727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2145  co-chaperone Hsc20  58.14 
 
 		 172 aa  202  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2287  co-chaperone Hsc20  54.65 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.198647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3996  co-chaperone Hsc20  59.3 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456652  normal  0.028593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2446  co-chaperone Hsc20  58.72 
 
 		 187 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2181  co-chaperone Hsc20  54.34 
 
 		 172 aa  184  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00609006  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2180  co-chaperone Hsc20  54.71 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00471531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2376  co-chaperone Hsc20  52.25 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.332037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1455  co-chaperone HscB  48.26 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1878  co-chaperone HscB  48.55 
 
 		 175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.328354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1705  co-chaperone HscB  49.13 
 
 		 175 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2729  co-chaperone HscB  49.13 
 
 		 175 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2214  co-chaperone HscB  49.13 
 
 		 175 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2596  co-chaperone HscB  49.13 
 
 		 175 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2652  co-chaperone HscB  49.13 
 
 		 175 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1556  co-chaperone HscB  47.09 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336849  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3106  co-chaperone HscB  49.12 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1486  co-chaperone HscB  49.12 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2576  co-chaperone HscB  45.93 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.922422  hitchhiker  0.00128374 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0472  co-chaperone Hsc20  44.05 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5429  co-chaperone HscB  47.4 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1062  co-chaperone HscB  45.61 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0805  co-chaperone Hsc20  44.58 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0526671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2033  co-chaperone HscB  46.24 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1953  co-chaperone HscB  44.07 
 
 		 175 aa  137  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00597172  normal  0.35074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1167  co-chaperone HscB  44.58 
 
 		 175 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.104058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2160  co-chaperone HscB  46.24 
 
 		 201 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.726593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0953  co-chaperone HscB  45.18 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1147  co-chaperone HscB  46.82 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234201  normal  0.0862801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0888  co-chaperone HscB  45.18 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1490  co-chaperone Hsc20  42.86 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5954  co-chaperone HscB  46.24 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2123  co-chaperone HscB  46.24 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2140  co-chaperone HscB  46.24 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1028  co-chaperone HscB  45.03 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121779  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2202  co-chaperone HscB  45.09 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0251  co-chaperone HscB  42.86 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1023  co-chaperone HscB  44.12 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187887  normal  0.466989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1461  co-chaperone HscB  40.59 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0280  co-chaperone HscB  40.12 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0282071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1241  co-chaperone HscB  37.65 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2748  co-chaperone HscB  42.77 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3624  co-chaperone HscB  39.76 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.784226  normal  0.865317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2314  co-chaperone HscB  37.28 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.963474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1822  co-chaperone HscB  37.28 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0713219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1742  co-chaperone HscB  37.28 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01058  co-chaperone HscB  35.54 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1171  co-chaperone HscB  39.52 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2267  co-chaperone HscB  37.28 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1107  co-chaperone HscB  38.04 
 
 		 172 aa  97.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0928477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2868  co-chaperone HscB  33.73 
 
 		 176 aa  97.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  hitchhiker  0.0000000210214 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02419  co-chaperone HscB  39.88 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1141  co-chaperone Hsc20  39.88 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2678  co-chaperone HscB  39.88 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0432  co-chaperone HscB  38.92 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02383  hypothetical protein  39.88 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1279  co-chaperone HscB  38.92 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1150  co-chaperone HscB  39.88 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2902  co-chaperone HscB  39.88 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.430469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3758  co-chaperone HscB  39.88 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00502648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0284  co-chaperone HscB  36.02 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004357  chaperone protein HscB  34.94 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2277  co-chaperone HscB  36.69 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2811  co-chaperone HscB  39.88 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.275401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2679  co-chaperone HscB  39.88 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2146  co-chaperone HscB  36.09 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000935401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3028  co-chaperone HscB  38.31 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1296  co-chaperone HscB  35.09 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0123344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2802  co-chaperone HscB  37.42 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0720  co-chaperone HscB  33.53 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1491  co-chaperone HscB  34.91 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1779  co-chaperone HscB  31.95 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000385415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3024  co-chaperone HscB  34.36 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0260581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0676  co-chaperone Hsc20  36.53 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2421  co-chaperone HscB  34.32 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1964  co-chaperone HscB  34.68 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0825  co-chaperone Hsc20  36.53 
 
 		 205 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484161  normal  0.641557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2499  co-chaperone HscB  33.73 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0105977  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2739  co-chaperone HscB  43.59 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2780  co-chaperone HscB  43.59 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.783416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2914  co-chaperone HscB  43.59 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2695  co-chaperone HscB  45.63 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.48899  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2383  co-chaperone HscB  34.68 
 
 		 174 aa  87.4  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000460884  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2394  co-chaperone HscB  34.32 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00154498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2056  co-chaperone HscB  41.55 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0804061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4609  co-chaperone HscB  36.53 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40370  co-chaperone HscB  49.5 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0595  co-chaperone Hsc20  43.69 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1135  co-chaperone HscB  32.54 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1240  co-chaperone HscB  45.24 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0621  co-chaperone Hsc20  42.72 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.567041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3508  co-chaperone HscB  38.36 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.935785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0640  co-chaperone Hsc20  43.69 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474346  normal  0.400649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0630  co-chaperone Hsc20  42.72 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1426  co-chaperone Hsc20  44.26 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1247  co-chaperone HscB  35.62 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.706414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>