120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0251 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0251  co-chaperone HscB  100 
 
 
177 aa  357  7e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1953  co-chaperone HscB  51.18 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00597172  normal  0.35074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0888  co-chaperone HscB  46.82 
 
 
179 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0953  co-chaperone HscB  46.24 
 
 
179 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0805  co-chaperone Hsc20  45.61 
 
 
177 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0526671  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1028  co-chaperone HscB  44.71 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121779  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1705  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2729  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2214  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3106  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2596  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2652  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1486  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1023  co-chaperone HscB  46.82 
 
 
176 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187887  normal  0.466989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1878  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
175 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.328354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2033  co-chaperone HscB  49.04 
 
 
201 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1556  co-chaperone HscB  45.96 
 
 
175 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336849  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1455  co-chaperone HscB  47.2 
 
 
175 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2160  co-chaperone HscB  49.04 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.726593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2576  co-chaperone HscB  45.34 
 
 
175 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.922422  hitchhiker  0.00128374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1062  co-chaperone HscB  43.2 
 
 
172 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5429  co-chaperone HscB  47.2 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143172  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2202  co-chaperone HscB  45.76 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0472  co-chaperone Hsc20  41.52 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15714  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1147  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234201  normal  0.0862801 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5954  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
175 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2123  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2140  co-chaperone HscB  46.58 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1167  co-chaperone HscB  41.18 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.104058  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1490  co-chaperone Hsc20  39.18 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2145  co-chaperone Hsc20  38.12 
 
 
172 aa  121  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1044  co-chaperone Hsc20  42.86 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2141  co-chaperone Hsc20  41.25 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00840727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2446  co-chaperone Hsc20  40.12 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1641  co-chaperone Hsc20  40.62 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2180  co-chaperone Hsc20  40.37 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00471531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1435  co-chaperone Hsc20  36.81 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.506311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2287  co-chaperone Hsc20  38.27 
 
 
172 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.198647  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3996  co-chaperone Hsc20  38.75 
 
 
172 aa  114  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456652  normal  0.028593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2259  chaperone protein  39.75 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.334367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3624  co-chaperone HscB  41.82 
 
 
173 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.784226  normal  0.865317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0280  co-chaperone HscB  39.88 
 
 
171 aa  104  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0282071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2314  co-chaperone HscB  35.93 
 
 
173 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.963474  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01058  co-chaperone HscB  39.88 
 
 
171 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1107  co-chaperone HscB  40 
 
 
172 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0928477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1241  co-chaperone HscB  36.36 
 
 
175 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2181  co-chaperone Hsc20  35.62 
 
 
172 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00609006  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40370  co-chaperone HscB  39.08 
 
 
173 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4609  co-chaperone HscB  39.08 
 
 
173 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155411  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004357  chaperone protein HscB  39.26 
 
 
171 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2376  co-chaperone Hsc20  36.59 
 
 
178 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.332037  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02419  co-chaperone HscB  38.04 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1141  co-chaperone Hsc20  38.04 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3758  co-chaperone HscB  38.04 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00502648  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02383  hypothetical protein  38.04 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2678  co-chaperone HscB  38.04 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1150  co-chaperone HscB  38.04 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161773  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2902  co-chaperone HscB  38.04 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.430469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0720  co-chaperone HscB  37.5 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3028  co-chaperone HscB  39.51 
 
 
172 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1171  co-chaperone HscB  39.05 
 
 
174 aa  99  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2811  co-chaperone HscB  38.04 
 
 
171 aa  99  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.275401  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1822  co-chaperone HscB  37.2 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0713219  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2748  co-chaperone HscB  42.41 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2679  co-chaperone HscB  38.04 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.418864  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1779  co-chaperone HscB  33.13 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000385415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2146  co-chaperone HscB  38.51 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000935401  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0432  co-chaperone HscB  38.46 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1279  co-chaperone HscB  38.46 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2267  co-chaperone HscB  38.24 
 
 
174 aa  97.8  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0845  co-chaperone HscB  37.29 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4333  co-chaperone HscB  37.85 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.147193  hitchhiker  0.000000000185961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0875  co-chaperone HscB  37.29 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1491  co-chaperone HscB  34.76 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0888  co-chaperone HscB  37.85 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2868  co-chaperone HscB  34.86 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  hitchhiker  0.0000000210214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1742  co-chaperone HscB  36.59 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142747  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1296  co-chaperone HscB  35.84 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0123344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1327  co-chaperone Hsc20  35.98 
 
 
169 aa  95.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1461  co-chaperone HscB  35.98 
 
 
174 aa  94.7  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2277  co-chaperone HscB  36.14 
 
 
174 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113627  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1135  co-chaperone HscB  35.15 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3024  co-chaperone HscB  34.97 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0260581  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2802  co-chaperone HscB  35.58 
 
 
171 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2499  co-chaperone HscB  39.32 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0105977  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3508  co-chaperone HscB  36.21 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.935785  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1426  co-chaperone Hsc20  36.21 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2056  co-chaperone HscB  37.14 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0804061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2421  co-chaperone HscB  37.88 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2394  co-chaperone HscB  40.78 
 
 
174 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00154498  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1964  co-chaperone HscB  40.78 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2383  co-chaperone HscB  40.78 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000460884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1240  co-chaperone HscB  35.63 
 
 
173 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612742  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0825  co-chaperone Hsc20  31.4 
 
 
205 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484161  normal  0.641557 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0676  co-chaperone Hsc20  31.4 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2739  co-chaperone HscB  33.74 
 
 
171 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2780  co-chaperone HscB  33.74 
 
 
171 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.783416  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2695  co-chaperone HscB  33.74 
 
 
171 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.48899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2914  co-chaperone HscB  33.74 
 
 
171 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14770  co-chaperone HscB  36.21 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>