139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1279 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0432  co-chaperone HscB  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1279  co-chaperone HscB  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1171  co-chaperone HscB  99.43 
 
 		 174 aa  347  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3624  co-chaperone HscB  78.24 
 
 		 173 aa  273  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.784226  normal  0.865317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1107  co-chaperone HscB  70.76 
 
 		 172 aa  254  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0928477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3028  co-chaperone HscB  67.52 
 
 		 172 aa  228  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2748  co-chaperone HscB  69.43 
 
 		 172 aa  226  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02419  co-chaperone HscB  66.67 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1141  co-chaperone Hsc20  66.67 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3758  co-chaperone HscB  66.67 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00502648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02383  hypothetical protein  66.67 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2902  co-chaperone HscB  66.67 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.430469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2678  co-chaperone HscB  66.67 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2811  co-chaperone HscB  66.67 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.275401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1150  co-chaperone HscB  66.67 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2679  co-chaperone HscB  66.67 
 
 		 171 aa  224  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3024  co-chaperone HscB  64.91 
 
 		 171 aa  216  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0260581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2802  co-chaperone HscB  64.91 
 
 		 171 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1247  co-chaperone HscB  67.52 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.706414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2914  co-chaperone HscB  65.5 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2739  co-chaperone HscB  65.5 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2780  co-chaperone HscB  65.5 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.783416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2695  co-chaperone HscB  64.91 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.48899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0720  co-chaperone HscB  52.35 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004357  chaperone protein HscB  48.82 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01058  co-chaperone HscB  48.82 
 
 		 171 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0280  co-chaperone HscB  50.59 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0282071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2314  co-chaperone HscB  42.77 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.963474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2267  co-chaperone HscB  45.76 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1296  co-chaperone HscB  42.29 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0123344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1742  co-chaperone HscB  44.25 
 
 		 174 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1135  co-chaperone HscB  42.61 
 
 		 175 aa  140  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2277  co-chaperone HscB  45.2 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1491  co-chaperone HscB  42.29 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1779  co-chaperone HscB  42.29 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000385415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1822  co-chaperone HscB  44.63 
 
 		 174 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0713219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2868  co-chaperone HscB  41.14 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  hitchhiker  0.0000000210214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2146  co-chaperone HscB  41.95 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000935401  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1241  co-chaperone HscB  44.25 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2421  co-chaperone HscB  41.81 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1461  co-chaperone HscB  39.08 
 
 		 174 aa  134  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1327  co-chaperone Hsc20  42.11 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2499  co-chaperone HscB  41.48 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0105977  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2383  co-chaperone HscB  41.48 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000460884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1964  co-chaperone HscB  43.1 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40370  co-chaperone HscB  44.57 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2394  co-chaperone HscB  41.48 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00154498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1240  co-chaperone HscB  41.14 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1426  co-chaperone Hsc20  41.14 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1167  co-chaperone HscB  38.24 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.104058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14770  co-chaperone HscB  42.94 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1953  co-chaperone HscB  42.07 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00597172  normal  0.35074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1062  co-chaperone HscB  41.42 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4609  co-chaperone HscB  41.71 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0805  co-chaperone Hsc20  38.95 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0526671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1028  co-chaperone HscB  40.83 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121779  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2056  co-chaperone HscB  40.12 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0804061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1302  co-chaperone HscB  42.35 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3508  co-chaperone HscB  41.14 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.935785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0875  co-chaperone HscB  38.24 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0845  co-chaperone HscB  38.24 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0953  co-chaperone HscB  41.28 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0888  co-chaperone HscB  41.28 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1705  co-chaperone HscB  40.12 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2729  co-chaperone HscB  40.12 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2214  co-chaperone HscB  40.12 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3106  co-chaperone HscB  40.12 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2596  co-chaperone HscB  40.12 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2652  co-chaperone HscB  40.12 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1486  co-chaperone HscB  40.12 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0888  co-chaperone HscB  38.24 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4333  co-chaperone HscB  38.29 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.147193  hitchhiker  0.000000000185961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2160  co-chaperone HscB  40.7 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.726593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2033  co-chaperone HscB  40.7 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5954  co-chaperone HscB  40.7 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2123  co-chaperone HscB  40.7 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2140  co-chaperone HscB  40.7 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1556  co-chaperone HscB  38.82 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336849  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5429  co-chaperone HscB  39.41 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1147  co-chaperone HscB  40 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234201  normal  0.0862801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1878  co-chaperone HscB  39.53 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.328354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2576  co-chaperone HscB  38.24 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.922422  hitchhiker  0.00128374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1455  co-chaperone HscB  35.93 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2202  co-chaperone HscB  40.24 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1641  co-chaperone Hsc20  38.46 
 
 		 172 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2141  co-chaperone Hsc20  38.46 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00840727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2145  co-chaperone Hsc20  38.75 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186352  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0284  co-chaperone HscB  36.69 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0640  co-chaperone Hsc20  43.94 
 
 		 207 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474346  normal  0.400649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3996  co-chaperone Hsc20  37.5 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456652  normal  0.028593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0251  co-chaperone HscB  38.46 
 
 		 177 aa  97.8  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1023  co-chaperone HscB  48 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187887  normal  0.466989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1044  co-chaperone Hsc20  38.92 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2259  chaperone protein  37.65 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.334367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1490  co-chaperone Hsc20  37.2 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0472  co-chaperone Hsc20  36.81 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1435  co-chaperone Hsc20  35.98 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.506311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2287  co-chaperone Hsc20  37.42 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.198647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2181  co-chaperone Hsc20  35.8 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00609006  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3059  co-chaperone Hsc20  36.52 
 
 		 207 aa  92.8  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>