135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1641 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1641  co-chaperone Hsc20  100 
 
 
172 aa  344  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2141  co-chaperone Hsc20  98.84 
 
 
172 aa  338  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00840727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3996  co-chaperone Hsc20  73.26 
 
 
172 aa  258  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456652  normal  0.028593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2446  co-chaperone Hsc20  76.74 
 
 
187 aa  243  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2376  co-chaperone Hsc20  70.22 
 
 
178 aa  243  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.332037  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2287  co-chaperone Hsc20  66.28 
 
 
172 aa  240  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.198647  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2180  co-chaperone Hsc20  67.06 
 
 
177 aa  230  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00471531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2259  chaperone protein  66.28 
 
 
172 aa  230  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.334367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2145  co-chaperone Hsc20  65.12 
 
 
172 aa  228  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2181  co-chaperone Hsc20  64.53 
 
 
172 aa  227  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00609006  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1044  co-chaperone Hsc20  60.69 
 
 
172 aa  206  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1435  co-chaperone Hsc20  60.84 
 
 
172 aa  205  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.506311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0953  co-chaperone HscB  50.6 
 
 
179 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0888  co-chaperone HscB  50.6 
 
 
179 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1878  co-chaperone HscB  50.87 
 
 
175 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.328354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1705  co-chaperone HscB  49.71 
 
 
175 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2729  co-chaperone HscB  49.71 
 
 
175 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2214  co-chaperone HscB  49.71 
 
 
175 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2596  co-chaperone HscB  49.71 
 
 
175 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2652  co-chaperone HscB  49.71 
 
 
175 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3106  co-chaperone HscB  49.71 
 
 
172 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1486  co-chaperone HscB  49.71 
 
 
172 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18319  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1167  co-chaperone HscB  47.98 
 
 
175 aa  151  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.104058  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1455  co-chaperone HscB  48.84 
 
 
175 aa  151  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5429  co-chaperone HscB  49.71 
 
 
175 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1556  co-chaperone HscB  48.26 
 
 
175 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336849  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2160  co-chaperone HscB  50.29 
 
 
201 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.726593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2033  co-chaperone HscB  50.29 
 
 
201 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1953  co-chaperone HscB  46.71 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00597172  normal  0.35074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2576  co-chaperone HscB  47.67 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.922422  hitchhiker  0.00128374 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5954  co-chaperone HscB  50.29 
 
 
175 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2123  co-chaperone HscB  50.29 
 
 
201 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2140  co-chaperone HscB  50.29 
 
 
201 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.641869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1147  co-chaperone HscB  50.29 
 
 
175 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234201  normal  0.0862801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1062  co-chaperone HscB  48.78 
 
 
172 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1028  co-chaperone HscB  50 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121779  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1023  co-chaperone HscB  52.69 
 
 
176 aa  134  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.187887  normal  0.466989 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0472  co-chaperone Hsc20  43.83 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15714  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1490  co-chaperone Hsc20  43.21 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0805  co-chaperone Hsc20  41.28 
 
 
177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0526671  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2202  co-chaperone HscB  48.81 
 
 
177 aa  127  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0251  co-chaperone HscB  40.62 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1241  co-chaperone HscB  38.24 
 
 
175 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3624  co-chaperone HscB  38.73 
 
 
173 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.784226  normal  0.865317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02419  co-chaperone HscB  37.72 
 
 
171 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1141  co-chaperone Hsc20  37.72 
 
 
171 aa  104  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02383  hypothetical protein  37.72 
 
 
171 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3758  co-chaperone HscB  37.72 
 
 
171 aa  104  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00502648  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2678  co-chaperone HscB  37.72 
 
 
171 aa  104  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1150  co-chaperone HscB  37.72 
 
 
171 aa  104  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161773  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2902  co-chaperone HscB  37.72 
 
 
171 aa  104  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.430469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0432  co-chaperone HscB  38.46 
 
 
174 aa  103  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00543464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1279  co-chaperone HscB  38.46 
 
 
174 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0280  co-chaperone HscB  37.72 
 
 
171 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0282071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1171  co-chaperone HscB  38.46 
 
 
174 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2811  co-chaperone HscB  37.72 
 
 
171 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.275401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2679  co-chaperone HscB  37.72 
 
 
171 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.418864  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1461  co-chaperone HscB  34.97 
 
 
174 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3024  co-chaperone HscB  36.53 
 
 
171 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0260581  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1107  co-chaperone HscB  39.41 
 
 
172 aa  101  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0928477  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0720  co-chaperone HscB  36.14 
 
 
171 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01058  co-chaperone HscB  39.88 
 
 
171 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1742  co-chaperone HscB  37.13 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142747  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1822  co-chaperone HscB  37.13 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0713219  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1296  co-chaperone HscB  37.74 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0123344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2267  co-chaperone HscB  35.44 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004357  chaperone protein HscB  35.93 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3028  co-chaperone HscB  38.96 
 
 
172 aa  98.2  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1491  co-chaperone HscB  34.78 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2277  co-chaperone HscB  38.32 
 
 
174 aa  97.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113627  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2146  co-chaperone HscB  35.33 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000935401  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2499  co-chaperone HscB  35.33 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0105977  hitchhiker  0.00824967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2748  co-chaperone HscB  49.02 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2394  co-chaperone HscB  35.93 
 
 
174 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00154498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2314  co-chaperone HscB  42.57 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.963474  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2383  co-chaperone HscB  35.33 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000460884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1779  co-chaperone HscB  32.91 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000385415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1327  co-chaperone Hsc20  35.76 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1964  co-chaperone HscB  35.33 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2802  co-chaperone HscB  37.72 
 
 
171 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2868  co-chaperone HscB  32.28 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  hitchhiker  0.0000000210214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1135  co-chaperone HscB  39.09 
 
 
175 aa  91.3  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0284  co-chaperone HscB  36.47 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2421  co-chaperone HscB  34.16 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40370  co-chaperone HscB  45.37 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2914  co-chaperone HscB  39.55 
 
 
171 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2780  co-chaperone HscB  39.55 
 
 
171 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.783416  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2739  co-chaperone HscB  39.55 
 
 
171 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2056  co-chaperone HscB  41.72 
 
 
183 aa  87.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0804061  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2695  co-chaperone HscB  39.55 
 
 
171 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.48899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3059  co-chaperone Hsc20  36.42 
 
 
207 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4333  co-chaperone HscB  43.24 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.147193  hitchhiker  0.000000000185961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0595  co-chaperone Hsc20  45.45 
 
 
205 aa  84.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0621  co-chaperone Hsc20  36.59 
 
 
205 aa  84.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.567041  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0630  co-chaperone Hsc20  36.59 
 
 
205 aa  84.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0833  co-chaperone Hsc20  38.95 
 
 
174 aa  84.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.59335  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0640  co-chaperone Hsc20  43.56 
 
 
207 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474346  normal  0.400649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1240  co-chaperone HscB  43.52 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.612742  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0875  co-chaperone HscB  41.44 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1426  co-chaperone Hsc20  34.1 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>