More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1483 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1483  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 152 aa  315  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  98.48 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  89.39 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  87.88 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  87.88 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  80.3 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  80.65 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  73.02 
 
 		 176 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  73.02 
 
 		 176 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  73.02 
 
 		 176 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  71.43 
 
 		 176 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  74.6 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  75 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  69.84 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  71.43 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  70.31 
 
 		 167 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  71.43 
 
 		 171 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  70.31 
 
 		 198 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  67.19 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  71.67 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  71.67 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  68.25 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  70.77 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  72.13 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  72.13 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  68.85 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  63.93 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  65 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  68.85 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  68.85 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  65.57 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  56.41 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  62.3 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  61.9 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  63.79 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  63.93 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  63.93 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  56.96 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  56.41 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  56.41 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  62.9 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  64.41 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  62.71 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  63.93 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  60.61 
 
 		 229 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  54.05 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  62.3 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  60.66 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  62.9 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  62.07 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  58.06 
 
 		 168 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  62.9 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  62.3 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  61.02 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 506 aa  82  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  59.38 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  59.32 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  59.32 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  59.02 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  59.02 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  62.71 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  62.3 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  57.38 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  61.02 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  64.41 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  59.02 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  48.81 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  61.02 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  60.32 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  57.38 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  63.16 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  49.41 
 
 		 397 aa  77  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  56.67 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  54.1 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  59.32 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  48.31 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  59.02 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  50.82 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  50.82 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  59.62 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  52.46 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  72.09 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>