More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0260 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  100 
 
 		 417 aa  845    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  73.32 
 
 		 418 aa  631  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  63.11 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  61.89 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  61.89 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  58.07 
 
 		 415 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  61.26 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  47.83 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  48.43 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  47.58 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  46.86 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  47.23 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  46.86 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  46.86 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  46.14 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  46.38 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  46.14 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  46.51 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  45.91 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  46.38 
 
 		 421 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  46.49 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  45.89 
 
 		 421 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  44.55 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  44.84 
 
 		 420 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  45.89 
 
 		 421 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  45.17 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  38.41 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  40.44 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  43.1 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  41.49 
 
 		 416 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  41.73 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  44.93 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  43 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  41.49 
 
 		 496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  42.38 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  41.49 
 
 		 416 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  41.01 
 
 		 416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  42.93 
 
 		 416 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  40.57 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  40.77 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  40.57 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  40.57 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  40.57 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  40.57 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  40.57 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  40.57 
 
 		 577 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  44.99 
 
 		 443 aa  302  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  41.47 
 
 		 422 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  40.57 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  40.29 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  40.77 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  44.72 
 
 		 418 aa  296  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  42.89 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  42.12 
 
 		 432 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  38.5 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  36.54 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  29.57 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  37.2 
 
 		 414 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  36.96 
 
 		 414 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  30.99 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  30.77 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  30.99 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  30.13 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  30.87 
 
 		 450 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  29.98 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  37.38 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  30.43 
 
 		 423 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  28.93 
 
 		 490 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  29.13 
 
 		 490 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  29.5 
 
 		 484 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  28.72 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  29.29 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  29.08 
 
 		 484 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  30 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  28.51 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  30.02 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  30.42 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  30.43 
 
 		 450 aa  189  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  32.89 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  29.31 
 
 		 488 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  32.11 
 
 		 455 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  33.25 
 
 		 461 aa  186  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  29.01 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  31.49 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  28.92 
 
 		 456 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  27.96 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  30.19 
 
 		 425 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  29.61 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  28.5 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.49 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  28.99 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  28.19 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  28.89 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  28.89 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  31.93 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  28.67 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  28.82 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  28.82 
 
 		 450 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  28.82 
 
 		 450 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  28.89 
 
 		 450 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>