More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2603 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  100 
 
 		 425 aa  873    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  74.47 
 
 		 423 aa  661    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  96.24 
 
 		 425 aa  845    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  72.04 
 
 		 423 aa  641    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  69.18 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  35.92 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  37.53 
 
 		 440 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  35.87 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  32.74 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  36.39 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  35.58 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  35.42 
 
 		 424 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  35.34 
 
 		 424 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  32.86 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  33.33 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  32.61 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  35.73 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  34.78 
 
 		 423 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  34.78 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  34.8 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  34.54 
 
 		 423 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  35.34 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  35.61 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  32.47 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  31.68 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  32.38 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  30.07 
 
 		 430 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  29.48 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0153  molecular chaperone-like protein  30.96 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  32.95 
 
 		 447 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  29.25 
 
 		 430 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  34.3 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  33.49 
 
 		 425 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  31.34 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  32.06 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  33.9 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  31.83 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  31.72 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  33.25 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  31.34 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  34.36 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  31.96 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  31.72 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  34.52 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  31.06 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  32.86 
 
 		 439 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  31.23 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  33.82 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  31.11 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  32.37 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  32.15 
 
 		 416 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  32.86 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  31.04 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  31.1 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  31.18 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  31.1 
 
 		 416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  30.94 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  30.19 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  30.1 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  30.29 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  30.86 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  30.86 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  29.88 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  29.85 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  31.26 
 
 		 416 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  28.02 
 
 		 418 aa  179  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  29.69 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  29.79 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  29.69 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  29.81 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  28.5 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  29.69 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  29.69 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  29.69 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  29.69 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  29.69 
 
 		 577 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  31.03 
 
 		 416 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  32.39 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  29.38 
 
 		 422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  31.34 
 
 		 422 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  30.22 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  29.37 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  28.54 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  28.4 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  27.54 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  28.07 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  26.08 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  28.5 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  27.78 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  29.36 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  27.7 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  26.34 
 
 		 450 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  22.98 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  25.65 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  26.4 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  25.43 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  25.43 
 
 		 450 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  24.19 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  26.74 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  23.31 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>