More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2603 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  95.43 
 
 
496 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  88.07 
 
 
420 aa  734    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  99.04 
 
 
416 aa  821    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  88.07 
 
 
577 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  97.36 
 
 
416 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  87.35 
 
 
471 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  100 
 
 
416 aa  832    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  95.43 
 
 
435 aa  794    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  99.76 
 
 
416 aa  831    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  88.07 
 
 
420 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  88.07 
 
 
420 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  91.59 
 
 
422 aa  744    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  88.78 
 
 
420 aa  740    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  88.07 
 
 
420 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  88.07 
 
 
420 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  76.44 
 
 
416 aa  628  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  76.44 
 
 
416 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  76.96 
 
 
422 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  69.23 
 
 
416 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  57.11 
 
 
438 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  53.29 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  47.03 
 
 
420 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  46.3 
 
 
425 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  45.52 
 
 
421 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  44.23 
 
 
420 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  44.07 
 
 
417 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  47.92 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  44.07 
 
 
417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  43.96 
 
 
425 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  43.2 
 
 
417 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  43.65 
 
 
417 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  42.86 
 
 
424 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  42.99 
 
 
421 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  42.07 
 
 
419 aa  330  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  42.62 
 
 
423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  46.29 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  42.62 
 
 
423 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  42.13 
 
 
421 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  42.62 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  42.62 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  44.55 
 
 
421 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  39.37 
 
 
428 aa  319  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  44.12 
 
 
437 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  44.12 
 
 
415 aa  316  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  43.65 
 
 
415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  45.79 
 
 
418 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  38.16 
 
 
419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  40.77 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  42.37 
 
 
421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  42.17 
 
 
419 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  42.21 
 
 
415 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  44.12 
 
 
415 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  42.13 
 
 
421 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  38.61 
 
 
418 aa  275  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  36.45 
 
 
412 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  35.27 
 
 
420 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  35.52 
 
 
412 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  31.25 
 
 
425 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  35.92 
 
 
414 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  32.35 
 
 
452 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  31.73 
 
 
423 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  35.68 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  30.94 
 
 
425 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  30.72 
 
 
456 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  30.5 
 
 
456 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  30.05 
 
 
423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  30.86 
 
 
425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  28.48 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  28.64 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  29.87 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  26.09 
 
 
454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  29.59 
 
 
450 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  29.44 
 
 
450 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  29.59 
 
 
450 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  29.44 
 
 
450 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  29.37 
 
 
450 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  29.37 
 
 
450 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  29.37 
 
 
450 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  31.04 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  29.74 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  28.88 
 
 
450 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  28.14 
 
 
455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  29.37 
 
 
450 aa  166  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  29.09 
 
 
450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  29 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  29.22 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  29.09 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  29.22 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  27.29 
 
 
450 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  29.09 
 
 
450 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  26.49 
 
 
484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  26.63 
 
 
490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  26.63 
 
 
490 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  27.43 
 
 
450 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  26.63 
 
 
490 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  28.79 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  27.35 
 
 
461 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  28.88 
 
 
450 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  26.42 
 
 
489 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  26.28 
 
 
484 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>