More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3761 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  856    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  49.19 
 
 
440 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  46.62 
 
 
428 aa  344  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  44.68 
 
 
447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  43.13 
 
 
434 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  41.86 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  41.55 
 
 
438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  40.1 
 
 
430 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  40.95 
 
 
429 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  41.61 
 
 
440 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  40.76 
 
 
430 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  45.33 
 
 
439 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  40.52 
 
 
430 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  37.32 
 
 
440 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  37.09 
 
 
438 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  36.03 
 
 
424 aa  270  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  41.88 
 
 
433 aa  265  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  35.7 
 
 
425 aa  253  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  35.87 
 
 
425 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  34.83 
 
 
425 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  34.99 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  33.49 
 
 
423 aa  230  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  32.15 
 
 
421 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  36.08 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  36.15 
 
 
421 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  35.92 
 
 
423 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  35.68 
 
 
423 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  35.45 
 
 
423 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  35.58 
 
 
424 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  34.04 
 
 
421 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  33.33 
 
 
444 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  34.57 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  35.06 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  36.85 
 
 
421 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  35.14 
 
 
417 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  35.06 
 
 
419 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  34.26 
 
 
416 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  35.38 
 
 
417 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  35.06 
 
 
417 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  33.33 
 
 
417 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  34.43 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  33.64 
 
 
424 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  34.34 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  34.34 
 
 
424 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  32.31 
 
 
420 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  32.86 
 
 
419 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  33.49 
 
 
417 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  33.81 
 
 
418 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  33.41 
 
 
418 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  35.6 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  34.19 
 
 
420 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  33.33 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  33.49 
 
 
415 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  34.2 
 
 
421 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  32.71 
 
 
428 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  34.25 
 
 
443 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  33.26 
 
 
437 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  33.25 
 
 
425 aa  169  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  33.49 
 
 
415 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  28.82 
 
 
450 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  34.03 
 
 
416 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  29.37 
 
 
419 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  28.82 
 
 
450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  28.82 
 
 
450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  34.78 
 
 
496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  34.78 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  33.94 
 
 
416 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  33.86 
 
 
422 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  28.17 
 
 
454 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  33.64 
 
 
416 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  33.02 
 
 
416 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  33.64 
 
 
416 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  30.41 
 
 
455 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  33.72 
 
 
420 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  33.64 
 
 
416 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  34.62 
 
 
422 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  27.72 
 
 
450 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  28.57 
 
 
450 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  28.45 
 
 
450 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0153  molecular chaperone-like protein  29.07 
 
 
448 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  28.45 
 
 
450 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  28.23 
 
 
450 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  30.45 
 
 
450 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  28.02 
 
 
456 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  28.69 
 
 
484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  35.03 
 
 
415 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  28.02 
 
 
450 aa  156  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  32.79 
 
 
416 aa  156  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  28.14 
 
 
450 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  33.26 
 
 
577 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  33.03 
 
 
471 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  28.14 
 
 
450 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  28.23 
 
 
450 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  28.23 
 
 
450 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  33.26 
 
 
420 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  33.26 
 
 
420 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  31.18 
 
 
432 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  33.26 
 
 
420 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  33.26 
 
 
420 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  33.26 
 
 
420 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>