More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0277 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  100 
 
 		 437 aa  869    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  93.49 
 
 		 415 aa  775    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  99.04 
 
 		 415 aa  816    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  75.18 
 
 		 415 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  61.89 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  62.44 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  62.62 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  50.24 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  47.2 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  50.6 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  48.06 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  47.2 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  45.5 
 
 		 421 aa  362  9e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  46.72 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  48.18 
 
 		 421 aa  358  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  45.26 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  47.09 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  46.23 
 
 		 421 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  46.99 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  47.45 
 
 		 421 aa  356  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  46.6 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  45.26 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  46.36 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  46.73 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  46.12 
 
 		 417 aa  349  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  41.91 
 
 		 419 aa  348  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  46.96 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  40.1 
 
 		 428 aa  328  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  44.6 
 
 		 416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  46.72 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  44.36 
 
 		 416 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  44.36 
 
 		 416 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  44.12 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  44.12 
 
 		 416 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  44.36 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  46.57 
 
 		 416 aa  315  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  44.94 
 
 		 422 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  44.29 
 
 		 420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  44.29 
 
 		 471 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  44.05 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  44.05 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  44.05 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  44.05 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  44.05 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  43.1 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  44.21 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  44.05 
 
 		 577 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  45.9 
 
 		 432 aa  305  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  42.48 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  42.72 
 
 		 416 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  44.19 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  43.09 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  44.66 
 
 		 418 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  40.24 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  39.56 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  40.87 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  41.81 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  40.29 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  39.66 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  31.09 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  32.04 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  29.36 
 
 		 456 aa  193  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  29.04 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  30.98 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  30.11 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  30.11 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  35.78 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  30.11 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  29.36 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  28.78 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  29.22 
 
 		 484 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  30.02 
 
 		 490 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  29.22 
 
 		 484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  29.82 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  30.56 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  30.52 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  29.07 
 
 		 490 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  29.27 
 
 		 489 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  28.64 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  29.87 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  29.01 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  28.1 
 
 		 450 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  30.1 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  28.91 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  29.85 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  29.08 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  30.55 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  30 
 
 		 440 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  28.57 
 
 		 456 aa  179  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  30.27 
 
 		 423 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  27.97 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  27.97 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  27.75 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  27.75 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  27.97 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  27.97 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  27.97 
 
 		 450 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  27.97 
 
 		 450 aa  172  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.26 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  27.84 
 
 		 450 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>