More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1223 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  71.56 
 
 		 450 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  72.44 
 
 		 450 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  72.22 
 
 		 450 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  100 
 
 		 450 aa  922    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  72.67 
 
 		 450 aa  679    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  71.78 
 
 		 450 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  72.44 
 
 		 450 aa  677    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  71.56 
 
 		 450 aa  669    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  72.67 
 
 		 450 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  72.44 
 
 		 450 aa  676    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  100 
 
 		 450 aa  922    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  72.44 
 
 		 450 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  83.78 
 
 		 450 aa  785    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  72.67 
 
 		 450 aa  679    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  71.78 
 
 		 450 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  72.83 
 
 		 450 aa  676    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  99.56 
 
 		 450 aa  919    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  72 
 
 		 450 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  68.22 
 
 		 456 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  68.44 
 
 		 449 aa  621  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  67.33 
 
 		 456 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  68 
 
 		 449 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  58.44 
 
 		 450 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  55.9 
 
 		 450 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  57.56 
 
 		 450 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  57.11 
 
 		 450 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  49.69 
 
 		 490 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  49.08 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  49.49 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  48.87 
 
 		 489 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  48.55 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  48.55 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  48.76 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  47.93 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  48.25 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  49.78 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  48.48 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  47.36 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  46.68 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  49.46 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  47.37 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  48.13 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  45.2 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  44.79 
 
 		 450 aa  358  7e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  37.82 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  35.84 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  32.81 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  32.82 
 
 		 421 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  32.6 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  32.02 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  31.19 
 
 		 501 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  32.17 
 
 		 423 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  32.17 
 
 		 423 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  32.17 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  32.39 
 
 		 421 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  31.8 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  33.26 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  34.54 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  32.89 
 
 		 417 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  32.37 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  31.97 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  32.74 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  32.53 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  31.3 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  30.99 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  31.94 
 
 		 421 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  32.1 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  31.78 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  31.3 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  31.79 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  31.04 
 
 		 420 aa  190  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  30.11 
 
 		 437 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  30.11 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  29.89 
 
 		 415 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  29.58 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  31.07 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  29.72 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  35.87 
 
 		 443 aa  173  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  30.8 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  30.74 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  29.65 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  29.74 
 
 		 496 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  27.61 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  29.33 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  29.09 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  29.22 
 
 		 416 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  29.22 
 
 		 416 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  30.58 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  28.82 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  29.22 
 
 		 416 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  29.22 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  29.65 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  29.87 
 
 		 420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  29.65 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  29.65 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  29.65 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  29.65 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  29.65 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  29.65 
 
 		 577 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  31.13 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>