More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0780 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  979    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  42.2 
 
 
455 aa  360  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  42 
 
 
457 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  42.53 
 
 
459 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  39.71 
 
 
468 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  40.33 
 
 
461 aa  339  8e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  37.84 
 
 
484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  37.84 
 
 
484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  39.5 
 
 
454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  37.84 
 
 
484 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  38.33 
 
 
490 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  38.33 
 
 
490 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  38.33 
 
 
490 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  38.4 
 
 
489 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  38.58 
 
 
484 aa  332  8e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  38.08 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  40.21 
 
 
450 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  36.47 
 
 
488 aa  323  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  38.11 
 
 
450 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  37.82 
 
 
450 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  37.82 
 
 
450 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  37.61 
 
 
450 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  36.93 
 
 
456 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  36.63 
 
 
450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  37.24 
 
 
456 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  37.05 
 
 
456 aa  299  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  36 
 
 
450 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  37.66 
 
 
450 aa  289  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  36.21 
 
 
450 aa  289  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  35.58 
 
 
450 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  35.37 
 
 
450 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  35.58 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  35.37 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  35.37 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  35.58 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  35.37 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  35.37 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  35.37 
 
 
450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  35.85 
 
 
450 aa  283  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  36.97 
 
 
449 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  36.42 
 
 
449 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  35.79 
 
 
418 aa  280  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  35.22 
 
 
450 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  36.46 
 
 
450 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  36.25 
 
 
450 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  36.25 
 
 
450 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  35.87 
 
 
500 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  31.65 
 
 
501 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  31.66 
 
 
437 aa  247  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  27.89 
 
 
425 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  28.87 
 
 
417 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  32.33 
 
 
428 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  29.01 
 
 
417 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  28.81 
 
 
417 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  28.81 
 
 
425 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01756  heat shock protein  29.2 
 
 
458 aa  177  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.322701  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  32.61 
 
 
471 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1615  heat shock protein  33.08 
 
 
503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  32.21 
 
 
417 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  32.13 
 
 
437 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  32.13 
 
 
415 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  31.86 
 
 
421 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  31.04 
 
 
416 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  31.4 
 
 
420 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  33.06 
 
 
418 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  28.4 
 
 
417 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  31.72 
 
 
421 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  31.04 
 
 
416 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  30.31 
 
 
420 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  31.47 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  31.4 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  31.4 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  31.04 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  31.04 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  30.19 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  31.4 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  31.4 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  31.4 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  30.19 
 
 
435 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  31.4 
 
 
577 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  32.02 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  31.58 
 
 
422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2937  heat shock protein  28.99 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4506  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  31.86 
 
 
421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  31.3 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  30.24 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  33.6 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  32.13 
 
 
415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  31.61 
 
 
421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  28.14 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  30.75 
 
 
423 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  30.75 
 
 
423 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  30.19 
 
 
422 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  30.47 
 
 
423 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  30.47 
 
 
421 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  29.87 
 
 
419 aa  156  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  29.97 
 
 
415 aa  153  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  29.92 
 
 
416 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  29.92 
 
 
416 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  30.69 
 
 
438 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>