More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1036 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  100 
 
 		 418 aa  845    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  73.32 
 
 		 417 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  62.44 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  62.68 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  62.44 
 
 		 437 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  57.11 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  61.26 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  48.67 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  47.57 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  47.7 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  47.7 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  46.97 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  46.49 
 
 		 424 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  46.97 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  46 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  47.09 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  46.14 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  46.25 
 
 		 423 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  46.25 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  46.25 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  46.3 
 
 		 420 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  47.58 
 
 		 421 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  45.52 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  46.14 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  44.39 
 
 		 419 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  45.89 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  39.47 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  45.89 
 
 		 421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  39.29 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  43.84 
 
 		 416 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  42.72 
 
 		 420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  43.69 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  40.67 
 
 		 416 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  41.47 
 
 		 432 aa  289  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  41.03 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  43.46 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  41.19 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  39.19 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  39.19 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  40.91 
 
 		 422 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  40.71 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  39.01 
 
 		 420 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  39.09 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  39.01 
 
 		 420 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  38.95 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  39.01 
 
 		 420 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  39.01 
 
 		 420 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  39.48 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  39.01 
 
 		 420 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  39.01 
 
 		 420 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  39.09 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  39.01 
 
 		 577 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  38.85 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  38.61 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  38.85 
 
 		 412 aa  232  9e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  37.95 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  32.24 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  39.36 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  31.76 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  31.97 
 
 		 450 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  31.97 
 
 		 450 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  39.17 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  38.69 
 
 		 414 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  34.41 
 
 		 490 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  34.41 
 
 		 490 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  30.64 
 
 		 484 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  30.64 
 
 		 484 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  34.41 
 
 		 490 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  29.87 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  34.16 
 
 		 489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  30.64 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  31.47 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  35.12 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  30.4 
 
 		 450 aa  196  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  35.08 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  29.69 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  28.95 
 
 		 450 aa  193  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  28.95 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  30.29 
 
 		 484 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  34.84 
 
 		 488 aa  189  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  29.62 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  28.99 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  30.14 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  30.14 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  33.96 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  34.66 
 
 		 450 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  33.26 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  28.02 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  28.47 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  28.44 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  28.48 
 
 		 456 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.41 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  28.22 
 
 		 450 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  28.22 
 
 		 450 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  28.22 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  28.22 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  28.22 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  28.22 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  28 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  28 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>