More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05559 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  93.56 
 
 
450 aa  877    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  72.89 
 
 
450 aa  697    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  100 
 
 
450 aa  931    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  57.91 
 
 
450 aa  551  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  57.56 
 
 
450 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  56.89 
 
 
450 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  57.56 
 
 
450 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  57.33 
 
 
450 aa  523  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  55.33 
 
 
450 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  56 
 
 
450 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  56 
 
 
450 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  56 
 
 
450 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  55.33 
 
 
450 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  55.11 
 
 
450 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  55.11 
 
 
450 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  55.11 
 
 
450 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  55.11 
 
 
450 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  55.11 
 
 
450 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  55.33 
 
 
450 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  56 
 
 
450 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  54.67 
 
 
450 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  52.43 
 
 
456 aa  500  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  52.65 
 
 
456 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  53.67 
 
 
450 aa  498  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  51.78 
 
 
449 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  52 
 
 
449 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  48.58 
 
 
457 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  46.92 
 
 
454 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  47.26 
 
 
455 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  44.49 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  44.49 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  44.29 
 
 
490 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  44.29 
 
 
490 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  44.4 
 
 
484 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  44.4 
 
 
484 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  44.61 
 
 
484 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  46.83 
 
 
459 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  44.54 
 
 
484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  43.9 
 
 
452 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  44.06 
 
 
488 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  44.96 
 
 
456 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  45 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  43.4 
 
 
468 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  42.24 
 
 
450 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  36.21 
 
 
475 aa  289  9e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  35.33 
 
 
418 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  35.56 
 
 
500 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  32.51 
 
 
501 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  30.87 
 
 
420 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  31.18 
 
 
437 aa  204  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  30.2 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  30.13 
 
 
421 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  29.75 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  31.92 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  29.75 
 
 
421 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  30.4 
 
 
425 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  29.46 
 
 
423 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  29.46 
 
 
423 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  30.43 
 
 
417 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  29.46 
 
 
423 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  30.4 
 
 
417 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  29.62 
 
 
418 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  29.31 
 
 
421 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  29.74 
 
 
417 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  29.3 
 
 
417 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  29.08 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  28.57 
 
 
428 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  32.5 
 
 
421 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  28.19 
 
 
417 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  28.12 
 
 
419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  28.29 
 
 
419 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  31.87 
 
 
421 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  26.14 
 
 
419 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  28.08 
 
 
416 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  28.1 
 
 
416 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  27.65 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  28.44 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  27.65 
 
 
416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  28.44 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  27.43 
 
 
496 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  27.43 
 
 
416 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  30.09 
 
 
443 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  27.99 
 
 
415 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  28.29 
 
 
420 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  27.21 
 
 
435 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  25.84 
 
 
415 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  28.29 
 
 
420 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  28.29 
 
 
420 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  28.29 
 
 
420 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  28.29 
 
 
420 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  28.29 
 
 
420 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  28.57 
 
 
577 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  27.83 
 
 
422 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  26.48 
 
 
416 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  27.83 
 
 
471 aa  156  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  26.5 
 
 
420 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  29.15 
 
 
415 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  27.86 
 
 
416 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  27.86 
 
 
416 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  27.39 
 
 
438 aa  153  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>