More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2099 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  100 
 
 		 456 aa  937    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  67.24 
 
 		 468 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  63.9 
 
 		 484 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  63.9 
 
 		 484 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  63.9 
 
 		 484 aa  628  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  63.9 
 
 		 484 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  65.8 
 
 		 461 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  66.01 
 
 		 457 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  63.3 
 
 		 488 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  62.01 
 
 		 490 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  61.6 
 
 		 489 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  61.6 
 
 		 490 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  61.4 
 
 		 490 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  66.45 
 
 		 459 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  63.32 
 
 		 455 aa  601  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  53.98 
 
 		 450 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  47.16 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  48.25 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  47.38 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  47.38 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  47.38 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  47.38 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  47.38 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  47.38 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  46.94 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  47.16 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  46.94 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  47.37 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  47.15 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  47.37 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  44.71 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  45.83 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  46.17 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  46.93 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  47.05 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  46.27 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  47.05 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  46.83 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  46.83 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  45.18 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  44.96 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  45.39 
 
 		 450 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  42.79 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  45.65 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  36.93 
 
 		 475 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  34.57 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  31.45 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  33.52 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  32.5 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  30.5 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  30 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  30.42 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  30.56 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  30.56 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  31.12 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  32.36 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  27.92 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  29.69 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  27.55 
 
 		 421 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  29.58 
 
 		 425 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  28.57 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  28.57 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  28.38 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  28.57 
 
 		 419 aa  176  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  27.27 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  27.27 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  28.98 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  27.06 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  27.33 
 
 		 421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  32.26 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  30.97 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  29.18 
 
 		 496 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  28.7 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  32.27 
 
 		 415 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  26.08 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  25.91 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  27.47 
 
 		 422 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  28.45 
 
 		 420 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  30.29 
 
 		 416 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  30.83 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  28.32 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  31.25 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  30.69 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  28.02 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01756  heat shock protein  28.99 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.322701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  30.57 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  30.28 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  30.57 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  28.73 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2937  heat shock protein  29.35 
 
 		 453 aa  154  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  27.75 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  28.29 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  30.75 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  30.97 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  29.56 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  27.75 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  29.56 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  29.31 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  29.31 
 
 		 577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  29.31 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>