More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4835 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  100 
 
 
452 aa  938    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  46.56 
 
 
450 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  46.02 
 
 
450 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  46.02 
 
 
450 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  46.02 
 
 
450 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  45.8 
 
 
450 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  46.02 
 
 
450 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  47.12 
 
 
450 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  46.02 
 
 
450 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  46.02 
 
 
450 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  45.13 
 
 
450 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  47.12 
 
 
450 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  45.58 
 
 
450 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  45.13 
 
 
450 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  45.8 
 
 
450 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  45.13 
 
 
450 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  46.12 
 
 
456 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  45.68 
 
 
456 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  45.01 
 
 
450 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  46.68 
 
 
450 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  46.68 
 
 
450 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  44.57 
 
 
450 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  44.15 
 
 
454 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  42.5 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  46.24 
 
 
449 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  44.32 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  44.71 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  42.29 
 
 
484 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  42.08 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  42.5 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  41.44 
 
 
490 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  42.06 
 
 
490 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  41.65 
 
 
489 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  42.16 
 
 
455 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  41.44 
 
 
490 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  44.35 
 
 
449 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  42.56 
 
 
488 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  42.73 
 
 
457 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  44.62 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  44.15 
 
 
450 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  43.9 
 
 
450 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  43.74 
 
 
459 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  40.65 
 
 
468 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  40.49 
 
 
450 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  38.08 
 
 
475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  34.44 
 
 
418 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  31.59 
 
 
501 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  32.19 
 
 
500 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  31.93 
 
 
437 aa  236  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  33.77 
 
 
424 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  32.6 
 
 
421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  35.92 
 
 
421 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  36.04 
 
 
423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  36.04 
 
 
423 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  36.04 
 
 
423 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  35.39 
 
 
421 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  35.03 
 
 
421 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  31.11 
 
 
420 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  29.78 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  32.39 
 
 
421 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  30.57 
 
 
417 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  32.72 
 
 
425 aa  209  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  30.13 
 
 
417 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  29.76 
 
 
417 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  30.46 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  28.17 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  30.13 
 
 
417 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  31.15 
 
 
421 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  29.87 
 
 
418 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  30.94 
 
 
421 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  28.63 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  29.04 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  29.04 
 
 
415 aa  190  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  29.19 
 
 
415 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  32.61 
 
 
416 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  32.35 
 
 
416 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  32.61 
 
 
416 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  33.42 
 
 
422 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  32.53 
 
 
471 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  32.61 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  32.08 
 
 
496 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  32.08 
 
 
435 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  31.81 
 
 
420 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  30.4 
 
 
443 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  29.13 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  31.81 
 
 
420 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  31.81 
 
 
420 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  31.81 
 
 
420 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  31.81 
 
 
420 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  31.81 
 
 
420 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  31.81 
 
 
577 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  32.7 
 
 
415 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  31.22 
 
 
416 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  27.51 
 
 
419 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  32.61 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  28.13 
 
 
416 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  31.45 
 
 
422 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  26.39 
 
 
428 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  31.81 
 
 
416 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  31.83 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>